تبدأ أعراض حساسية الجلوتين، أو مرض سيلياك الظاهرية بتكرار الاستفراغ والتقيئ ثم يكون الجلد باهتاً ويحدث استسقاء وانتفاخ للبطن مع فقد للوزن ومن ثم تأخر واضح في النمو والبلوغ، وقد يحدث إسهال شديد ومتكرر أو إمساك، كما يكون لدى المريض سوء تغذية لعد امتصاص العناصر الغذائية بسبب فقد جزء كبير من خملات الأمعاء الدقيقة، وعندما يبدأ المرض في سن الطفولة فإنه يسبب تأخر البلوغ وبطء النمو ويؤثر على معدل الطول فيكون الشخص قصير القامة ضامر العضلات مع نقص الوزن عن المعدل الطبيعي، ومن الأعراض الواضحة فقر الدم الناتج عن سوء امتصاص المواد الغذائية ومنها؛ الحديد وحمض الفوليك وفيتامين ب 12. وقد يحدث تقرح للفم وبثور في الأرجل ووخز وتخدر فيهما وقد يسبب بتغير موعد الدورة الشهرية لدى النساء. بالنسبة للأطفال الأكبر سنا والمراهقين تحدث لهم مشاكل نفسية مثل الإحباط والقلق والتوتر وعدم القدرة على التحصيل الدراسي. كما يحدث للكبار المصابين بهذا المرض مشكلة القولون العصبي والتهابات المعدة والأمعاء وتقرحات جوانب الفم وربما تكرار الإسهال.