البكتيريا الموجودة في الجهاز الهضمي، يمكن أن تؤثر في كيمياء الدماغ. كما يمكن السلوك والأدوية، مثل المضادات الحيوية، التأثير في عمل الأمعاء، وفق دراسة كندية. ووجد الباحثان، ستيفن كولينز وبرميسل بريك، أن تعطيل عمل البكتيريا الطبيعية الموجودة في الجهاز الهضمي للفئران، من طريق المضادات الحيوية، يحدث تغييرات في السلوك. لكن بعد وقف المضادات الحيوية، عادت البكتيريا في الجهاز الهضمي إلى طبيعتها، ورافق ذلك"عودة إلى السلوك الطبيعي والكيمياء الدماغية الطبيعية". وتعدّ هذه النتائج مهمة لأن أنواعاً رائجة من أمراض الجهاز الهضمي، ترتبط، في كثير من الحالات، بالقلق أو الاكتئاب. كما أن بعض الأمراض النفسية، مثل التوحّد، ربما تكون مرتبطة أيضاً بخلل في تلك البكتيريا الموجودة في الجهاز الهضمي.