أسفرت قرعة الدور ربع النهائي لكأس الاتحاد الآسيوي 2012 عن مواجهات قوية ومثيرة، يبرز من بينها مواجهة عربية بين الكويت الكويتي والوحدات الأردني. وفي المقابل يلعب الاتفاق السعودي مع اريما الإندونيسي، وأربيل العراقي مع كيلانتان الماليزي، وتشونبوري التايلاندي مع الشرطة السوري. أما في الدور قبل النهائي فيلتقي الفائز من مباراة الكويت والوحدات مع الفائز من اريما والاتفاق، في حين يتقابل الفائز من أربيل وكيلانتان مع الفائز من تشونبوري والشرطة. كما تم إجراء قرعة منفصلة من أجل تحديد الفريق المضيف للمباراة النهائية، وذلك بين الفائز من قبل النهائي 1 وقبل النهائي 2، حيث أسفرت القرعة عن إقامة المباراة النهائية الفائز في مباراة الدور قبل النهائي رقم (2)، والتي تجمع بين الفائز من أربيل وكيلانتان مع الفائز من تشونبوري والشرطة. ويشارك في ربع النهائي أندية: أربيل العراقي، الوحدات الأردني، الاتفاق السعودي، الكويت الكويتي، الشرطة السوري، كيلانتان الماليزي، تشونبوري التايلاندي واريما الإندونيسي. وتم توزيع الأندية على مباريات الدور ربع النهائي (ربع النهائي 1، ربع النهائي 2، ربع النهائي 3، ربع النهائي 4) وبحيث تقام مباراة مباراة الذهاب على أرض الفريق الذي تم اختياره أولاً، في حين يستضيف الفائزان في ربع النهائي 1 وربع النهائي 2 مباريات الذهاب في الدور قبل النهائي. ويقام ربع النهائي يومي 18 و25 سبتمبر/أيلول (الذهاب)، وقبل النهائي يومي 2 و23 أكتوبر/تشرين الأول، على أن تجري المباراة النهائية يوم السبت 3 نوفمبر/تشرين الثاني. قرعة الدور ربع النهائي : (1) الكويت الكويتي - الوحدات الأردني (2) اريما الإندونيسي - الاتفاق السعودي (3) أربيل العراقي - كيلانتان الماليزي (4) تشونبوري التايلاندي -الشرطة السوري قرعة الدور قبل النهائي : (1) الفائز من ربع النهائي (1) - الفائز من ربع النهائي (2) (2) الفائز من ربع النهائي (3) - الفائز من ربع النهائي (4) النهائي : الفائز من قبل النهائي (2) - الفائو من قبل النهائي (1)