ان قوة ونشاط الجهاز الهضمي، والكفاءة هي المؤشرات الرئيسية للصحة العامة والعافية. أثناء عملية الهضم، والغذاء كيميائيا (الإنزيمات) وجسديا (مضغ) موزعة، استيعابها في الدم، ونقلها بعد ذلك في جميع أنحاء الجسم، وتوفير الغذاء للخلايا. هي عوامل مهمة لصحة البدن وان انخفاض قيمته، وضعف، وغير ذلك من عوامل الهضم أو ان تكون غير فعالة يمكن أن يضر جهاز المناعة، وهما مترابطان بشكل وثيق. في الواقع، العديد من الخلايا المناعية الموجودة داخل الجهاز الهضمي، وتحديدا داخل المصاحب الأمعاء اللمفاوية الأنسجة، وهو ما يمثل حوالي 70 في المئة من كامل الجهاز المناعي. ضعف الجهاز المناعي يمهد الطريق لكثير من الأمراض التنكسية الخطيرة. الأسباب الرئيسية لضعف الهضم هي اتباع نظام غذائي غير صحي يؤدي إلى سوء التغذية. طرق إعداد الطعام هي أيضا بالغة الأهمية فيما يتعلق بجهاز الهضم. تنقع البذور والمكسرات، والحبوب، والبقوليات لمدة 8 إلى 24 ساعة، على سبيل المثال، يزيد بشكل كبير من هضم. التخمير، ودرجات الحرارة المنخفضة الطبخ، التحضيرات الأولية، وغيرها من أساليب إعداد الطعام جعل الطعام أكثر هضماً. وتشمل الأسباب الأخرى للضعف الهضم، والإجهاد المزمن، الإفراط في المشروبات الضارة، والمضادات الحيوية، والجراثيم المعوية غير المتوازنة. نتيجة واحدة من الإهمال الهضمي لفترة طويلة هي الأمعاء غير نفاذية، وهذا يعني بطانة الأمعاء حصل لها تلف، والذي يجعل الجزيئات غير مهضوم الغذاء، ويسبب البكتيريا، والسموم لدخول مجرى الدم. لأن هذه المواد ليست موجودة بشكل طبيعي في الدم، يتعرف الجهاز المناعي لهم كمستضدات. هذا يتسبب في النظام المناعي للافراج عن الأجسام المضادة والجزيئات، السيتوكينات، التي تؤدي إلى تنبيه خلايا الدم البيضاء التي تقاوم المضادات. تسبب هذه العملية الكثير من التهابات المحلية والنظامية ويرتبط مع الشروط التالية: الحساسية أمراض المناعة الذاتية مرض الاضطرابات الهضمية ومرض كرون أمراض المفاصل الالتهابية، بما في ذلك التهاب المفاصل متلازمة التعب المزمن حب الشباب، الأكزيما، والصدفية الحساسية الغذائية والحساسيات ضعف الكبد التهاب المفاصل الروماتويدي العصبي متلازمة الأمعاء ببساطة، لا يمكنك أن تكون بصحة جيدة دون أمعاء صحية. حركات الأمعاء تعد مؤشرا جيدا للصحة الأمعاء. إذا كانت منتظمة وبشكل جيد، وازدهار، ثم لديك القناة الهضمية وربما يحتاج بعض الاهتمام. الأمعاء منزل النظام البيئي الحيوي حيوية تتألف من نحو 500 الأنواع البكتيرية المختلفة. تعرف النباتات الأمعاء (أو الجراثيم المعوية)، وهذه الكائنات الدقيقة تتعايش مع الانسان (وغيرها من الحيوانات) في العلاقات التكافلية. النباتات الأمعاء تؤدي العديد من الوظائف الهامة، بما في ذلك مساعدة الهضم، تفادي البكتيريا المسببة للأمراض، وتدريب الجهاز المناعي على الاستجابة مسببات الأمراض فقط، تنظم القناة الهضمية التطوير، وتوليف الفيتامينات الأساسية. الخلايا البكتيرية هي غزيرة حتى داخل كل إنسان، ويفوق عدد خلايا الإنسان من عشرة إلى واحد. ليس كل هذه البكتيريا، ومع ذلك، هي جيدة بالضرورة. Emg هو وجود خلل في البكتيريا السيئة الناجمة عن تعاطي المضادات الحيوية والمبيدات الحشرية، والنظام الغذائي غير السليم. السكر المفرط، على سبيل المثال، يغذي البكتيريا السيئة (الفطريات والخمائر، والبكتيريا اللاهوائية) وذلك على حساب الصالح. المبيدات الحشرية ومبيدات الأعشاب ومبيدات الحشرات، ومبيدات الفطريات أيضا تضر البكتيريا الجيدة. الأطعمة المخمرة، بما في ذلك الزبادي والخضراوات المخمرة، وميسو هي مصادر غنية من البروبيوتيك، التي تعزز النباتات و الأمعاء الصحية. كفاءة الهضم مؤشر للعافية الجراثيم المعوية وهذه الكائنات الدقيقة تتعايش مع الإنسان في العلاقات التكافلية