خلصت دراسة أجريت على نحو 2300 رجل في الهند إلى أن الختان يقلل إصابة الذكور بفيروس "أتش آي في" المسبب لمرض نقص المناعة المكتسبة إيدز. وأوضح ستيفن رينولدز الباحث في كلية الطب في جامعة جونز هوبكنز في بلتيمور أن السطح الداخلي للجلد الزائد الذي يزال في عملية الختان ليست له الطبقة الواقية نفسها التي توجد في السطح الخارجي للجلد، ولهذا ربما كان أكثر عرضة للإصابة بالفيروس. كما درس رينولدز احتمالات إصابة الذكور المختونين وغير المختونين بأمراض أخرى تنتقل أثناء ممارسة الجنس. وعلى رغم أن الفروق كانت طفيفة فإن معدلات الإصابة بعدوى أمراض مثل الزهري والسيلان وقوباء الأعضاء التناسلية كانت أعلى بين الذكور غير المختونين. وفي الولاياتالمتحدة يجر ختان نحو ثلثي المواليد الذكور تقريباً كل عام. فيما تختلف معدلات ختان الذكور حول العالم وفقاً للثقافة والدين.