تتبع المؤسسة العامة للخطوط الحديدية نظاما في ترجيع تذاكر المسافرين لا يستهوي روادها و محبيها، وتضيع حقوقهم المادية في قيمة التذاكر المرجعة، والمتبع هو أن قيمة التذكرة لا يتم استرجاعها إلا قبل الرحلة بساعات، وإلا فستكون ملغية ولا قيمة لها، ولا توجد خدمة الحجز عن طريق الهاتف، كما هو متبع في خطوط الطيران، فالمسافر يتجشم العناء في القدوم إلى المحطة، ليحجز ويقطع تذكرته، فإذا ما حصل له ظرف طارئ يمنعه من السفر أو حتى الرجوع مرة أخرى للمحطة قبل موعد رحلته بساعات، فهذا يعني إلغاء قيمة تذكرته، ولا يحق له استرجاع قيمتها. ويؤكد عدد من المواطنين بأنه في السابق لم يكن هذا مطبقا، وأثار التطبيق استياء من النظام الذي تتبعه المؤسسة في إرجاع تذاكر المسافرين.. مطالبين بان تكون هناك دراسة كافية لهذا القرار، من قبل إدارة المؤسسة العامة للخطوط الحديدية، بما يتوافق مع ظروف المسافرين.