أفضى انفصال الجنوب إلى إحداث فراغ في مقاعد البرلمان السوداني بنهاية دور حزب الحركة الشعبية لتحرير السودان بمجرد إعلان إقامة دولة في الجنوب، برئاسة زعيم الحزب سلفاكير. وتعد السودان الأولى عربيا من حيث تعدد الأحزاب السياسية فيها، إذ يتشكل فيها نحو 30 حزبا سياسيا على تنوع توجهاتها الوطنية والدينية والعرقية والجغرافية، يتصدرها حزب المؤتمر الوطني الحاكم منذ سنة 1998م. ومن أبرز الأحزاب الأخرى حزب الأمة القومي، الحزب الاتحادي الديمقراطي، الحزب الشيوعي، حزب المؤتمر الشعبي، حزب المنبر الديمقراطي لجبال النوبة وحزب الحقيقة الفدرالي.