تنفذ وكالة التخطيط والتطوير في الرئاسة العامة لهيئة الأمر بالمعروف والنهي عن المنكر، مجموعة من البرامج التنفيذية والمبادرات، بما يتسق مع رؤية المملكة 2030، لتطوير الجانبين الميداني والإداري في الرئاسة. ومن تلك البرامج التي يُعد لها 10 برامج هي: برنامج إدارة الخطة الإستراتيجية، ويهدف إلى ضمان تنفيذ ومتابعة الخطة الإستراتيجية والتقويم المستمر والتحديث الدوري لها، وتحقيق الانسجام بين خطط الإدارات الفرعية والخطة الإستراتيجية، ونشر ثقافة التخطيط، ومتابعة تنفيذ خطط الإدارات والفروع والهيئات والمراكز وتقويمها، وبرنامج الإعداد لتطبيق برنامج الملك سلمان، حفظه الله، لتنمية الموارد البشرية، الهادف إلى الاستثمار في الموارد البشرية ورفع جودة أداء الموظف الحكومي وزيادة إنتاجيته، وبرنامج تطوير الهيكل التنظيمي للرئاسة العامة مع مراعاة الاحتياج الحالي والمستقبلي للرئاسة وفق الخطة الإستراتيجية، وتحديد المهام والاختصاصات. وتعد وكالة التخطيط والتطوير أيضاً، برنامج يستهدف الإجراءات الإدارية والميدانية بالرئاسة العامة، من خلال وضع وتيسير الإجراءات وتوحيد العمل بها، وزيادة مستوى الشفافية في تنفيذ الإجراءات، والعمل على تطبيقها إلكترونياً. وخصصت الرئاسة مشروعاً للاحتياجات التدريبية، يهدف إلى تحديد المسارات التدريبية والتخطيط للبرامج والمناهج التدريبية.