أوقفت جامعة أم القرى أكثر من 80 رسالة ماجستير ودكتوراه بمختلف الأقسام بسبب عدم تسديد رسوم التعليم الموازي الأمر الذي أدى إلى تذمر كثير من طلاب الدراسات العليا نظرا لأن هذا الموقف يناقض توجيها ساميا بتسديد رسوم التعليم الموازي في كافة الجامعات إلى الطلاب. من جانبه، أكد عميد كلية خدمة المجتمع والتعليم المستمر الدكتور ياسر شوشو، أنهم رفعوا أسماء الطلاب الدارسين إلى وزارة المالية لسداد الرسوم، ولكن لم تصل بعد، وفي حال وصولها ستعاد الرسوم للطلاب، لافتاً إلى أن الجامعة ملتزمة لأعضاء هيئة التدريس بإعطائهم حقوقهم نظير تدريسهم طلاب التعليم الموازي. وكان وزير التعليم العالي الدكتور خالد العنقري قد دعا في حوار صحفي الجامعات لإعادة رسوم التعليم الموازي سواء للبكالوريوس أو الماجستير أو الدكتوراه للطلاب وذلك تنفيذا للأمر السامي. إلى ذلك، أكد حامد الإقبالي، وعبيد مديني العسافي طالبا ماجستير، أن الرسوم المفروضة على الدراسات العليا تتراوح بين 15 و18 ألف ريال، وأنها مبالغ فيها ولا يستطيع معظم الطلاب سدادها. وقالا إن عددا من الطلاب تقدموا لاستكمال الدراسات العليا بناء على القرار الملكي الذي تكفل بقيمة مصاريف الدراسات العليا في "التعليم الموازي" بداية من عام 1428ه.