أوقفت جامعة أم القرى أكثر من 80 رسالة (ماجستير ودكتوراه) بمختلف الأقسام بسبب عدم تسديد رسوم التعليم الموازي الأمر الذي أدى الى تذمر الكثير من طلاب الدراسات العليا كونه يناقض توجيه خادم الحرمين الشريفين الملك عبدالله بن عبدالعزيز آل سعود - حفظه الله - بتسديد رسوم التعليم الموازي في كافة الجامعات الى الطلاب. وقالوا : إن الرسوم المفروضة على الدراسات العليا ما بين 15 و18 ألف ريال، وهي عالية جداً، ومبالَغٌ فيها، وفوق طاقتنا، فمنا مَنْ لم يلتحق بعمل بعد، أو لديه التزامات أُسَرية ومعيشية، ومن تزوج ويعول أسرة. وأضاف عدد منهم في بأنهم تقدموا لاستكمال الدراسات العليا بناء على القرار الملكي بالتكفل بقيمة مصاريف الدراسات العليا في "التعليم الموازي" بداية من عام 1428ه. وقال الطلاب إن الرسوم لم تُعِدها لهم الجامعة حتى الآن. مطالبين مدير الجامعة بالاستجابة لمطالبهم وإعادة الرسوم إليهم؛ لأن الكثيرين منهم اقترضوها من أقارب وأصدقاء، ومعظمهم في بداية حياتهم، ومنهم من لا عمل له، أو راتبهم يكاد يكفيهم أُسَرياً. وقال عطية بن عبدالله – طالب ماجستير موازي- (لقد تعبنا من مماطلة الجامعة ومواعيدها المتتالية في تأخير دفع كامل الرسوم فأتمنى من الدكتور العساس الذي تولى إدارة الجامعة مؤخراً توضيح وجهة نظر الجامعة حول الموضوع والذي بدأ يؤثر سلباً في علاقة الجامعة بأبنائها طلاب وطالبات التعليم الموازي) مؤكدا بأن الجامعة قامت بالتشهير بهم بعرض أسمائهم مراجعة الكلية في جميع اقسام الجامعة. واشار الى أنه بعد أن تقدمنا للحصول على القبول في الماجستير المسائي (المدفوع) اجبر الكثير بعد أن اغلقت في وجهه أبواب القبول الصباحي (المجاني) على طلب غريب هو أن يدفع جميع المرشحين للمقابلة الشخصية رسوم (سنة كاملة) وقدرها18000 ريال رغم أن الجامعات الأخرى مثل جامعة الملك عبدالعزيز وقعت الطلاب على تعهدات بدفع الرسوم في حالة عدم شمولهم بالمكرمة الملكية. محمد الشيخي :قال الكل يعلم بالأمر السامي الكريم وصدوره على تحمل الدولة تكاليف الدراسة ببرنامج التعليم الموازي في الجامعات السعودية وهو أمر عهدناه من لدن خادم الحرمين الشريفين إحساساً منه بأبنائه الطلاب وحرصه على إكمالهم لدراستهم، لنرى العديد من الجامعات السعودية تبادر إلى تنفيذ أمره السامي وتعيد إلى الطلاب الرسوم التي تم تحصيلها مسبقاً ماعدا جامعة أم القرى التي نرجو من المسؤولين فيها سرعة المبادرة إلى تنفيذ هذا الأمر السامي دون قيود أو شروط. طالب بقسم التربية الاسلامية والمقارنة قال شملتنا المكرمة الملكية لكننا لم نسلم من التخبطات التي تواجهنا والعقبات التي نتفاجأ بها بين حين وآخر فحين بحثنا عن استعادة الرسوم وبعد مداولات ومراجعات على مدى عام كامل ،تفاجئنا الجامعة بصرف نصف المبلغ وقدرة تسعة آلاف ريال والباقي مؤجل إلى أجل غير مسمى.. كأن الجامعة تطالبنا كأفراد ذوي دخل محدود بدفع الرسوم كاملة وهي على كثرة مواردها وميزانيتها عاجزة عن إعادة المبلغ كاملاً. من جهته قال الدكتور ياسر شوشو عميد كلية خدمة المجتمع والتعليم المستمر إنهم رفعوا اسماء الطلاب الدارسين الى وزارة المالية ليتم تسديد هذه الرسوم ولكن لم تصل بعد وفي حال وصولها ستتم اعادة الرسوم للطلاب لافتاً الى ان الجامعة ملتزمة لاعضاء هيئة التدريس بإعطائهم حقوقهم نظير تدريسهم طلاب التعليم الموازي. وكان وزير التعليم العالي د خالد العنقري قد قال في حوار صحفي إن على الجامعات إعادة رسوم التعليم الموازي سواء للبكالوريوس أو الماجستير أو الدكتوراه للطلاب بأمر سام.