أوقفت جامعة أم القرى أكثر من 80 رسالة ماجستير ودكتوراة بمختلف الأقسام بسبب عدم تسديد رسوم التعليم الموازي الأمر الذي أدى الى تذمر الكثير من طلاب الدراسات العليا كونه يناقض التوجيه بتسديد رسوم التعليم الموازي في الجامعات كافة الى الطلاب وقامت بعرض أسمائهم في كل ركن من الجامعة. وقالوا إن الرسوم المفروضة على الدراسات العليا ما بين 15 و18 ألف ريال، وهي عالية جدًا، ومبالَغٌ فيها، وفوق طاقتنا، فمنا مَنْ لم يلتحق بعمل بعد، أو لديه التزامات أُسَرية ومعيشية، ومن تزوج ويعول أسرة. وقال عطية بن عبدالله (طالب ماجستير موازي): لقد تعبنا من مماطلة الجامعة ومواعيدها المتتالية في تأخير دفع كامل الرسوم فأتمنى من الدكتور العساس الذي تولى إدارة الجامعة مؤخرا توضيح وجهة نظر الجامعة حول الموضوع والذي بدأ يؤثر سلبا في علاقة الجامعة بأبنائها طلاب وطالبات التعليم الموازي. مؤكدا أن الجامعة قامت بالتشهير بهم بعرض اسمائهم مراجعة الكلية في جميع اقسام الجامعة. واضاف: بعد أن تقدمنا للحصول على القبول في الماجستير المسائي (المدفوع) اجبر الكثير بعد أن اغلقت في وجهه أبواب القبول الصباحي (المجاني) على طلب غريب هو أن يدفع جميع المرشحين للمقابلة الشخصية رسوم (سنة كاملة) وقدرها 18 الف ريال رغم أن الجامعات الأخرى وقعت الطلاب على تعهدات بدفع الرسوم في حالة عدم شمولهم بالمكرمة الملكية. اما محمد الشيخي فقال ان الكل يعلم بالأمر السامي الكريم وصدوره على تحمل الدولة تكاليف الدراسة ببرنامج التعليم الموازي في الجامعات السعودية وهو أمر عهدناه من لدن خادم الحرمين الشريفين إحساسا منه بأبنائه الطلاب وحرصه على إكمالهم لدراستهم، لنرى العديد من الجامعات السعودية تبادر إلى تنفيذ أمره السامي وتعيد إلى الطلاب الرسوم التي تم تحصيلها مسبقًا ما عدا جامعة أم القرى التي نرجو من المسؤولين فيها سرعة المبادرة إلى تنفيذ هذا الأمر السامي دون قيود أو شروط. وقال طالب بقسم التربية الاسلامية والمقارنة: شملتنا المكرمة الملكية لكننا لم نسلم من التخبطات التي تواجهنا والعقبات التي نتفاجأ بها بين حين وآخر فحين بحثنا عن استعادة وبعد مداولات ومراجعات على مدى عام كامل، تفاجئنا الجامعة بصرف نصف المبلغ وقدرة تسعة آلاف ريال والباقي مؤجل إلى أجل غير مسمى، كأن الجامعة تطالبنا كأفراد ذوي دخل محدود بدفع الرسوم كاملة وهي على كثرة مواردها وميزانيتها عاجزة عن إعادة المبلغ كاملًا. من جهته قال الدكتور ياسر شوشو عميد كلية خدمة المجتمع والتعليم المستمر أنهم رفعوا اسماء الطلاب الدارسين الى وزارة المالية ليتم تسديد هذه الرسوم ولكن لم تصل بعد وفي حال وصولها سيتم اعادة الرسوم للطلاب، لافتا الى ان الجامعة ملتزمة لاعضاء هيئة التدريس باعطائهم حقوقهم نظير تدريسهم طلاب التعليم الموازي.