أسفرت قرعة الدور الثاني لكأس العرب للأندية 2012/2013 والتي أقيمت في العاصمة الأردنية عمّان عن مواجهة نادي النصر السعودي مع الحد البحريني كما أسفرت عن مواجهة نادي الفتح السعودي مع العربي الكويتي ، ومواجهة القوة الجوية العراقية مع شباب الظاهرية الفلسطيني ، ونادي الشعب الأردني مع البقعة الأردني. حيث تقام مباريات الذهاب في 27 نوفمبر 2012م والإياب سيكون في 5 ديسمبر 2012م .وستجري مباريات هذا الدور بخروج المغلوب من مباراتين ذهاب وإياب. يذكر أن ممثلي المملكة ناديي الفتح والنصر كانا يخشيان مقابلة الفريق القلسطيني أو العراقي نظراً لأن نظام البطولة يقرر إقامة المباريات على أراضيهم حيث إن الفلسطينيين يستندون إلى خطاب من الفيفا يسمح لهم بذلك وهذا مايعني انسحاب أحد الفرق نظراً لصعوبة الدخول إلى فلسطين واللعب معه أو العراق واللعب معه . حيث سبق لفريق العروبة العماني الانسحاب نظراً لأن مباراة الإياب في الدور التمهيدي أقيمت في فلسطين. يذكر أن النصر كان قد تأهل لهذا الدور مباشرة بفضل القرعة حيث لم يخض الدور التمهيدي على عكس الفتح الذي خاض مباراة ذهاب وإياب من أمام الجهراء الكويتي واستطاع الفوز فيهما بالأولى بهدفين مقابل هدف والثانية بهدف مقابل لا شيء.