اعتبرت الجمعية الوطنية لحقوق الإنسان «أن استفتاء الشعب السويسري لحظر بناء المساجد يعد انتهاكا لحرية الأديان، ويخالف المادة 18 من الإعلان العالمي لحقوق الإنسان، التي أعطت لكل شخص حقه إظهار دينه أو معتقده وإقامة شعائره الدينية». وأشارت الجمعية في بيان لها إلى أن الاستفتاء السويسري «يؤجج الصراع بين أتباع الأديان، ويعرقل الحوار، ويوسع الهوة التي سببتها المواقف العدائية ضد الإسلام من قبل بعض السياسيين الغربيين، الذي يعد انتهاكا لحقوق الإنسان، ولا يخدم التعايش بين الشعوب». ودعت الجمعية المؤسسات الحقوقية والإنسانية في العالم إلى العمل من أجل نبذ الممارسات التي تدعو إلى الكراهية وعدم احترام التنوع الثقافي والديني.