أكدت وزارة التربية والتعليم على اهمية متابعة ورصد الآثار الجانبية التي تظهر بعد استخدام اللقاح الخاص بانفلونزا الخنازير للطلاب، واشارت مؤخراً اللجنة التنفيذية للتوعية بوباء انفلونزا الخنازير في تعميم ارسل عاجلاً الى النموذج المقدم من شؤون الدواء في الهيئة العامة للغذاء والدواء وتوزيع ذلك النموذج على الوحدات الصحية لاستخدامها في الإبلاغ عن اي آثار جانبية قد تحدث بعد استخدام للقاح حيث اشتملت الاستمارة على 15 نوعا من الآثار المحتمل حدوثها عند اخذ اللقاح ومنها: احمرار مكان التطعيم، الم مكان التطعيم، حدوث تورم مكان التطعيم، حدوث ارتفاع في درجة الحرارة اكثر من 37,5، حدوث صداع او دوخة، الم في العضلات او المفاصل، اعراض جلدية (طفح، كدمات، نزيف مؤقت بالجلد)، اسهال وتقيء تشنجات او نوبة صرع، انتفاخ في الغدد الليمفاوية، التهابات الاوعية الدموية، التهاب الجهاز العصبي المركزي، التهاب العصب آلام شديدة في العصب متلازمة (جليان باري).