انطلقت جامعة الباحة في 1426ه بثلاث كليات هي: كلية الهندسة، وكلية العلوم، وكلية العلوم الطبية التطبيقية. وقد ضمت إلى الجامعة مؤخرا، الكليات التابعة لوزارة التربية والتعليم، سواء الكليات المخصصة للطلاب مثل كلية إعداد المعلمين بالباحة، وكذلك الكليات المخصصة للطالبات مثل: كلية التربية للبنات بالباحة، وكلية التربية للبنات بالمخواة، وكلية إعداد المعلمات ببلجرشي، وكليات خدمة المجتمع التابعة لجامعة أم القرى، وهي كلية المجتمع بالباحة، وكذلك كلية المجتمع للبنات بالمندق. بدأ التعليم الجامعي بالمنطقة في عام 1402ه بافتتاح كلية تربية متوسطة بالباحة، التي طورت في عام 1412ه إلى كلية تربية جامعية (نظام أربع سنوات) وتمنح درجة البكالوريوس والكلية مخصصة للطالبات. وفي عام 1409ه تم افتتاح كلية إعداد المعلمين التي تمنح درجة البكالوريوس (نظام أربع سنوات) والكلية مخصصة للطلاب فقط. وفي عام 1417ه تم افتتاح كلية تربية متوسطة بمحافظة المخواة، وتم تطويرها إلى كلية تربية تمنح درجة البكالوريوس (نظام أربع سنوات)، وذلك في عام 1422ه والكلية مخصصة للطالبات، وفي عام 1418ه تم افتتاح كلية إعداد معلمات المرحلة الابتدائية بمحافظة بلجرشي، وتمنح درجة البكالوريوس (نظام أربع سنوات) وفي عام 1422ه تم افتتاح كلية المجتمع بالباحة والكلية مخصصة للطلاب، وفي عام 1423ه تم افتتاح كلية المجتمع بمحافظة المندق وهي مخصصة للطالبات، وبالتالي فإن الجامعة كانت تحتوي على تسع كليات موزعة على أكثر من محافظة منها: بلجرشي والمخواة والمندق، وتحتوي هذه الكليات على (52) قسما علميا، منها أقسام تمنح درجة البكالوريوس، وأقسام تمنح درجة الدبلوم. وتمت إعادة هيكلة عدد من الكليات في العام الجامعي 1430-1431ه لإلحاقها بمنظومة التعليم الجامعي، ولتتفق مع أهداف الجامعة. كما تم افتتاح عدد من الكليات الجديدة، فأصبح عدد كليات الجامعة ثلاث عشرة كلية، تضم تسعة وخمسين قسما علميا، مما أدى إلى ارتفاع عدد الطلاب المقبولين في مختلف كليات الجامعة للعام الجامعي الحالي 1431-1432ه إلى (5100) طالب وطالبة. وتم إقرار عدد من برامج الدراسات العليا التي تمنح درجتي دبلوم الدراسات العليا، والماجستير بالتعاون مع جامعات عالمية عريقة.