دعا زعيم تنظيم القاعدة ايمن الظواهري في رسالة صوتية نشرت على الانترنت الى "وقف القتال بين اخوة الجهاد والاسلام في سورية". ووجه الظواهري في رسالته، التي تتزامن مع انطلاق مؤتمر "جنيف 2"، نداءاً الى "كل المجموعات الجهادية، وكل حر في الشام يسعى لاسقاط حكم الاسد"، وقال "ندعوهم جميعاً للسعي الى ايقاف القتال بين اخوة الجهاد والاسلام فوراً".