بدأت مشاركات المنتخب البحريني في نهائيات كاس أمم آسيا في البطولة التاسعة التي استضافتها الدوحة عام 1988، ولم تكن نتائجها ايجابية فخرجت من مجموعتها، بعدما خسرت من الصين وسورية بنتيجة واحدة صفر- 1، وتعادلت مع السعودية 1-1 والكويت سلبياً. والمشاركة الثانية كانت ايجابية في نهائيات الصين عام 2004، وحققت المرتبة الرابعة كأفضل انجاز آسيوي لها، إذ تعادلت مع الصين 2- 2 وقطر 1-1 وكسبت اندونيسيا 3-1، وتأهلت للدور ربع النهائي وكسبت أوزبكستان بركلات الترجيح 4-3 بعد التعادل 1-1، وفي الدور نصف النهائي خسرت بشرف من اليابان 3-4، وحققت المركز الرابع بعد خسارتها من إيران 2-4. ومجموع مبارياتها في نهائيات آسيا عشر مباريات، فازت في مباراتين وتعادلت أربع مرات وخسرت أربع مرات. وجاء تأهلها لنهائيات 2007 بعد أن احتلت المرتبة الثانية في المجموعة الرابعة برصيد أربع نقاط خلف استراليا المتصدرة، وجاءت الكويت ثالثة ولبنان في المركز الأخير. وأوقعتها القرعة في المجموعة الرابعة التي ضمت السعودية وكوريا الجنوبية واندونيسيا التي تستضيف هذه المجموعة، ويقود البحرين المدرب التشيخي ميلان ماتشالا الذي سبق أن قاد السعودية والكويتوالإماراتوعمان، وله خبره طويلة في نهائيات آسيا بدأت منذ عام 1996 مع المنتخب الكويتي. وتضم البحرين نجوماً بارزين أمثال محمد سالمين وعلاء حبيل هداف نهائيات الصين 2004 ومحمد حبيل وفوزي عايش. والمنتخب البحريني في آخر مشاركة له في"خليجي 18"في الإمارات تأهل للدور نصف النهائي وخسر من عمان، كما تأهل المنتخب الاولمبي إلى التصفيات النهائية عن قارة آسيا المؤهلة لدورة الألعاب العالمية في بكين 2008. وأفضل انجاز للكرة البحرينية حصول منتخب الناشئين على المركز الرابع في نهائيات كأس العالم للناشئين عام 1989، التي فازت بها السعودية، كما تأهلت لنهائيات كأس العالم للشباب عام 1987، واحتلت المرتبة الثانية لكأس آسيا للشباب عام 1987، كما حصل منتخب الناشئين على المركز الثاني عام 1988.