وقعت جامعة تبوك شراكات علمية مع 13 جامعة عالمية، وتبادل الخبرات مع تلك الجامعات. واتفقت جامعة تبوك مع جامعة سدني في استراليا في مجال الترخيص والتوريد والتشغيل والصيانة، والتدريب لبنك الأسئلة المعد، والمعلوماتي «كومباس»، وجامعة كوينز لاند في أستراليا في مراجعة وتقويم وتطوير المناهج والخطة الدراسية، وتأكيد الجودة لكلية الطب في جامعة تبوك، وجامعة موناش في أستراليا في تطوير مهارات وقدرات أعضاء هيئة التدريس في كلية الطب، وجامعة كوكمين في كوريا الجنوبية في مجال التبادل الطلابي، وإجراء أبحاث مشتركة، وتبادل أعضاء هيئة التدريس وعقد دورات وندوات من الجانبين، وتجهيز معمل النانوتكنولوجي. وشملت الاتفاقات التعاون مع جامعة كولون في ألمانيا في مجال التعاون العلمي والأكاديمي، وإنشاء معامل للتعليم الخاص وجامعة، لويزفيل في أميركا في بناء وتطوير معامل الربوت في جامعة تبوك، وجامعة التكنولوجيا الكيميائية وعلم المواد المعدنية في بلغاريا في مجال استخدام مركبات النانو في إنتاج مطاط واقٍ للمعادن، وجامعة فالنسيا في اسبانيا للعمل على إقامة إدارة النفايات الطبية في مدينة تبوك وجامعة فرات في تركيا في تصميم وتوصيف الأجهزة البيوسنور، وجامعة نابولي في إيطاليا في استخدام تكنولوجيا النانو للكشف عن نظام نوفر فوتون، وجامعة حاجة تبة في تركيا في مجال عقد أبحاث على تأثير فيتامين D على مرضى الربو. واتفقت مع جامعة وارلكو للتكنولوجيا في بولندا في مجال عقد بحث لرفع تركيز خام الفوسفات باستخدام النانوتكنولوجي، وجامعة توسو كوبا في اليابان في مجال مسح صيدلاني لبعض النباتات التي لها نشاط علاجي لمرضى السكري. وعقدت الجامعة شراكات مجتمعية مثمرة وتوقيع مذكرات تفاهم مع عدة قطاعات حكومية وجمعيات خيرية في المنطقة، منها جمعية الأمير فهد بن سلمان الخيرية لرعاية مرضى الفشل الكلوي، والجمعية الوطنية لحقوق الإنسان، والرئاسة العامة لهيئة الأمر بالمعروف والنهي عن المنكر، والأمن العام، وحرس الحدود، ووزارة العمل، والشؤون الاجتماعية، وإنشاء كراسي للأبحاث، منها كرسي الأمير فهد بن سلطان لأبحاث التقنيات المتقدمة في الكشف عن الأمراض ومسبباتها والمساهمة في علاجها، وكرسي الأمير فهد بن سلطان لقضايا الشباب وتنميتهم.