تأسس فرع الجمعية الخيرية لرعاية الأيتام بالخرج في شهر رمضان من عام 1426 ه . ويهدف الفرع إلى تقديم الرعاية للأيتام ومن في حكمهم في مدن المحافظة والمراكز التابعة لها من ذوي الظروف الخاصة منذ الولادة وحتى يستطيعوا مواجهة الحياة وتأهيلهم لكسب العيش بما يكفل لهم الاعتماد بعد الله على أنفسهم ومواجهة الحياة ليكونوا أفراداً منتجين نافعين لأنفسهم وأسرهم وصالحين في مجتمعهم بجانب ترسيخ مبادئ الدين الإسلامي لدى الأيتام وتوفير أوجه الرعاية الاجتماعية والتعليمة والصحية لهم . ويعمل فرع الجمعية على تنمية موارده المالية عن طريق التبرعات والهبات والصدقات والزكوات والأوقاف والاستثمارات كما يعمل على تنفيذ العديد من البرامج المختلفة خلال العام ومنها برنامج كفالة اليتيم ويهدف إلى تشجيع الأسر على كفالة الأيتام ومن في حكمهم لدى الأسر الطبيعية والحاضنة والبديلة ويقوم الأخصائيون والاخصائيات الاجتماعيون بالجمعية بالمتابعة الدورية لكفالة اليتيم للتأكد من أن اليتيم المكفول يحظى بالرعاية الاجتماعية والنفسية والتربوية والصحية اللائقة من خلال برنامج عمل دوري منظم لزيارات الأسر . وتنفذ الجمعية برنامج صندوق التكافل وهو صندوق تكافل اجتماعي يتم تمويله عن طريق التبرعات وعن طريق مخاطبة الشركات والمؤسسات والأفراد وذلك لجمع التبرعات حيث يتم توفير أجهزة منزلية وأدوات مدرسية عن طريق هذه المبالغ بالإضافة إلى المساهمة في تسديد الإيجار للأسر المحتاجة لذلك وتسديد الفواتير الخاصة بالخدمات حسب احتياج كل أسرة إضافة إلى تعليم الأيتام وتدريبهم من أجل تهيئتهم لسوق العمل ليعتمدوا على أنفسهم ويقوموا بتوفير احتياجاتهم واحتياجات أسرهم . وتهتم الجمعية ببرنامج الأسرة البديلة وهي الأسرة التي تعهد إليها تربية طفل حرم من رعاية أسرته الطبيعية أو من حضانة من تجب عليه حضانته من أقاربه ويهدف إلى تعويض الطفل اليتيم الذي حرم من الرعاية الأسرية الطبيعية وذلك عن طريق إيجاد جو مشابه لجو الأسرة الطبيعية من خلال وجود أسرة فيها الام والأب والإخوة والأخوات ويحصل الطفل اليتيم على جميع الخدمات التي يمكن أن يحصل عليها أي طفل في أسرته الطبيعية . كما تنفذ الجمعية برامج أخرى كبرنامج " الأيتام في ضيافة " ويشتمل على زيارات يقوم بها الأيتام إلى بعض المسؤولين ورجال الأعمال وبرنامج " صديق اليتيم " الذي يهدف إلى تشجيع استضافة اليتيم لدى الأسر في المجتمع لفترات محدودة كإجازات الصيف ونهاية الأسبوع والعيدين والمناسبات والحفلات العامة والخاصة وحتى ليوم واحد أو وجبة واحدة وبرنامج " الصناديق الفردية للوقف الخيري " ويهدف إلى إنشاء صناديق بأسماء الأفراد من أهل الخير الراغبين بوقف مال يستثمر على أن يعود ريع استثماره للجمعية بحيث يصبح رأس المال ثابتا والريع صدقة جارية . كما تنفذ الجمعية برنامج " الرسم والكتابة هوايتي " ويختص باكتشاف وصقل موهبتي الرسم والكتابة لدى الأيتام ليتاح لهم حرية التعبير عن مشاعرهم وما يدور في خلجات أنفسهم حيث تساعدهم الجمعية وتمدهم بالأدوات اللازمة لذلك وبرنامج " الدمج في المجتمع " وهو موجه للأيتام ومن في حكمهم الموجودين في المراكز الإيوائية ويهدف إلى إخراج الأيتام من عزلتهم ودمجهم في المجتمع . كما تنفذ الجمعية الخيرية لرعاية الأيتام بالخرج برنامج " الرعاية اللاحقة " وهو موجه للكبار من الأيتام الذي انتهت صلتهم بالمؤسسات الإيوائية أو الأسر البديلة ولكنهم مازالوا يحتاجون للرعاية الإيوائية الملحة لحين اطمئنان الجمعية على استقرارهم الاجتماعي والعملي بالإضافة إلى تنفيذ الجمعية برنامج " الخدمات المؤقتة والطارئة " وهو متاح لجميع الأيتام بهدف مساعدة اليتيم على حل مشاكله العاجلة أو الضرورية أو تقديم خدمات النصح والإرشاد والتوجيه أو معالجة انحرافات سلوكية قبل تفاقمها أو مساعدتهم في الحصول على استشارات أو حقوق شرعية تخصهم . ومن البرامج التي تعد لها الجمعية حالياً إنشاء المراكز الإيوائية النموذجية الخاصة والذي يهدف إلى إقناع رجال الأعمال والموسرين بافتتاح مراكز إيوائية في مدن المحافظة والمراكز التابعة لها لأعداد محدودة من الأيتام على أن تكون هذه المراكز بأسماء المتبرعين أو أسماء عائلاتهم أو عبر وقف خيري ويتم تمويل وتشغيل هذه المراكز الصغيرة من قبل هؤلاء الشخصيات وبإشراف ومتابعة من الجمعية . كما تقدم الجمعية برامج أخرى كبرنامج " جائزة اليتيم المتميز " وتكون باسم إحدى الشخصيات المهمة في البلاد ممن لها باع طويل في مجال الخير والبر والإحسان وتمنح هذه الجائزة لعدد من الأيتام المتميزين علماً وخلقاً كل عام أو مرتين في العام الواحد وبرنامج " المزايا الخاصة بالأيتام " من خلال التنسيق مع والمؤسسات التعليمة والتدريبية والمعاهد والكليات والجامعات والمدارس الخاصة والمجمعات التجارية والمراكز السكنية والمراكز الطبية والصيدليات ورجال الأعمال والمؤسسات التجارية الكبرى لتوفير فرص العمل والتدريب للأيتام ومنح مزايا ونسب وتخفيضات ترى الجمعية أهميتها لتسهيل حياة اليتيم أثناء مراحل رعايته من قبل الجمعية وبرنامج " رعاية الأيتام من سن الثامنة عشرة فما فوق " وتشتمل رعايتهم ومتابعة أحوالهم عن طريق المشرفين والمشرفات من حيث التدريب أو مواصلة التعليم ومحاولة إيجاد فرص عمل لهم . وتشمل برامج الجمعية كذلك برنامج " رعاية الأيتام عن طريق صديق اليتيم " وتتمثل في أن يكون صديق اليتيم مرجعاً له ومؤهلاً لحل مشاكله عندما يحتاج إلى حل مشكلة اعترضت حياته ويحتاج إلى مساعدة لحلها أو عند تعاملهم مع المؤسسات العامة والخاصة من أجل تذليل الصعوبات التي يواجهونها وتدريبهم على ذلك وبرنامج " فنجان شاي " ويعد هذا البرنامج أحد البرامج التي ينفذها القسم النسائي بالجمعية ويهدف إلى جمع التبرعات بواسطة عضوات اللجنة الاجتماعية النسائية بحيث تدعو كل عضوه عدد من السيدات وتقترح بأن تدفع كل واحدة منهن مبلغاً قيمة فنجان شاي لصالح يتيم ويتم الدفع بموجب كوبونات طبعت لهذا الغرض بحيث تتوالى الدعوات إلى أن تتسع إلى اكبر عدد ممكن من سيدات المجتمع المتبرعات وبرنامج " الإعلام والعلاقات العامة " وهو برنامج إعلامي يسعى إلى إبراز رسالة الجمعية لمختلف شرائح المجتمع عبر وسائل الإعلام المختلفة بالإضافة إلى تنظيم الندوات والمحاضرات وورش العمل وإعداد المطويات والنشرات والمشاركة بمختلف الفعاليات والمناسبات كالمعارض والمهرجانات وأسابيع الخدمة .