ولد الأمير محمد بن نايف بن عبدالعزيز عام 1959 وهو الابن الثاني للأمير نايف بن عبدالعزيز ، درس مراحل التعليم الابتدائية والمتوسطة والثانوية بمعهد العاصمة في الرياض، ثم درس المرحلة الجامعية بالولايات المتحدة وحصل على بكالوريوس في العلوم السياسية عام 1981، كما خاض عدة دورات عسكرية متقدمة داخل وخارج المملكة تتعلق بمكافحة الإرهاب. صدر الأمر الملكي في مايو 1999 بتعيينه مساعدًا لوزير الداخلية للشؤون الأمنية بالمرتبة الممتازة. ومددت خدماته لمدة أربع سنوات قبل أن يصدر أمر ملكي آخر بتعيينه مساعدًا لوزير الداخلية للشؤون الأمنية بمرتبة وزير في عام 2005. وكان الأمير محمد بن نايف تعرض في 27 أغسطس 2009 لمحاولة اغتيال من قبل مطلوب ادعى أنه يرغب بتسليم نفسه، حيث قام بتفجير نفسه بواسطة هاتف جوال وتناثر جسد المنتحر إلى أشلاء، وأصيب الأمير بجروح طفيفة. عين اليوم بأمر ملكي وزيرا للداخلية خلفا للأمير أحمد بن عبدالعزيز الذي أعفي من منصبه بناء على طلبه.