حصل مستشفى الثغر العام بجدة على ( الإعتماد المؤسسي ) من الهيئة السعودية للتخصصات الصحية كمركز تدريبي وذلك بعد تحقيقه معايير الإعتماد الخاصة . حيث يهدف الإعتماد المؤسسي إلى تسخير كافة الإمكانات الإدارية و التعليمية و السريرية بالمراكز التدريبية لأغراض التدريب في برامج الدراسات العليا الصحية المهنية ( شهادة الاختصاص العام ، زمالة التخصص الدقيق أو الدبلوم المهني الصحي ) ، التي تشرف عليها الهيئة ، مما ينتج عنه توفير بيئة تعليمية متميزة للمدربين و المتدربين مبنية على أسس التعليم الصحي ، ليتمكن المتدرب من الحصول على تدريب عالي يؤهله للممارسة المهنية الآمنة في مجال تخصصه .