بدأت وزارة الصحة رفع أوامر الدفع لوزارة المالية بطريقة إلكترونية في خطوة تهدف إلى التحول للتعامل المالي الإلكتروني ، وذلك بهدف سرعة الإنجاز والحد من المعاملات الورقية ، وإستغلال التقنية بما يتوافق مع أفضل الممارسات العالمية،وتحقق هذه المبادرة التي تمت بالتنسيق والعمل المشترك مع وزارة المالية آثاراً إيجابية عدة منها تقليل الأخطاء والربط الإلكتروني مع وزارة المالية . وتمثل هذه الخطوة إحدى المبادرات المشتركة مع وزارة المالية للارتقاء بالعمل المالي الحكومي وتفعيل الشفافية ومساندة برنامج التحول في وزارة الصحة.