انطلاقاً من حرص وزارة الصحة على تقديم خدمة طبية عالية المستوى لحجاج بيت الله من خلال المختبرات الطبية المجهزة بأحدث التقنيات العلمية الدقيقة والتي تساعد على تشخيص حالة المريض بأقصى سرعة وأعلى جودة ودقة فقد تم ادخال تشغيل المختبر التخصصي لخدمة ضيوف الرحمن في مستشفى منى العام تم تزويده بكوادر مؤهلة من الاستشاريين والفنيين. ويضم المختبر العديد من الوحدات والاقسام التخصصية اهمها وحدة الكيمياء الحيوية التي تقوم بفحص ما يقارب اربعين تحليلاً بأجهزة اتوماتيكية متقنة تشمل قياس نسبة السكر في الدم والاملاح والدهون وانزيمات الكلى والكبد والبنكرياس بالاضافة الى قياس نسبة الانزيمات القلبية في حالة تعرض المريض لأزمة قلبية. كما يضم المختبر وحدة ابحاث الدم مزودة بكمية كبيرة من وحدات الدم والبلازما والصفائح الدموية بجميع فصائلها حيث تم التأكد من سلامتها بالاضافة الى وحدة الاحياء الدقيقة ومختبر الدم الذي يعد المختبر الوحيد بمستشفى منى العام والذي يقوم باجراء جميع الفحوصات الجرثومية تحسباً لظهور اية امراض وبائية ومعدية - لا سمح الله - الى جانب ذلك يضم المختبر وحدة المناعة والامصال لاجراء الفحوصات المناعية والمصلية للامراض المعدية الهامة والتي يخشى على الحجيج الاصابة بها مثل التيفوئيد والحمى المالطية وكذلك وحدة الطفيليات لاجراء فحوصات البول والبراز واكتشاف الامراض الطفيلية والمعدية في وقت مبكر. كما يضم المختبر وحدة الاستقبال وتسليم النتائج تقوم باستقبال العينات وتسليم النتائج لمنسوبي الاقسام العلاجية.