أصدر مركز تاريخ مكةالمكرمة عددًا من المطبوعات العلمية، وهي: كتاب «صفحات من تاريخ مكةالمكرمة» ترجمة الدكتور محمد السرياني والدكتور معراج مرزا، وكتاب «أعلام وحدود الحرم المكّي الشريف» تأليف الدكتور خضران الثبيتي والدكتور سعود الثبيتي، وكتاب «الحج إلى مكةالمكرمة من شبه القارة الهندية» ترجمة الدكتور معراج مرزا والدكتور بدر الدين أحمد، وكتاب «الحياة العلمية في مكةالمكرمة 1115 1334ه /1703 1916م» تأليف الدكتورة آمال رمضان، والأطلس المصور لمكةالمكرمة والمشاعر المقدسة (باللغة الإنجليزية) تأليف الدكتور معراج مرزا والدكتور عبدالله شاووش. كما يعتزم المركز في هذا السياق طباعة ثلاثة كتب، هي: «مدينتا الجزيرة العربية المقدستان» ترجمة الدكتور عبدالله نصيف، و«مقام إبراهيم عليه السلام» تأليف محمد الكردي، ودراسة معالي الشيخ عبدالوهاب أبو سليمان، وتاريخ أمة في سيرة أئمة ويتكون من خمسة مجلدات من تأليف الشيخ صالح بن حميد. كما يسعى المركز في هذا الإطار إلى حصر الرسائل العلمية الأكاديمية عن تاريخ مكةالمكرمة لاقتنائها وإعادة طبع المتميز منها، كما يتلقى المركز عددًا من المقترحات ومشروعات لكتب علمية يتم دراستها ومن ثم إقرار طباعتها ونشرها.