بدأ مصطفى خاطر مسيرته الفنية مبكراً عبر التمثيل في مسرح كلية الحقوق في جامعة عين شمس حيث كان يدرس، ومن ثم التحق للعمل كمخرج في فرقة «رموز». حاز شهرته عقب المشاركة في مواسم من عروض «تياترو مصر». كما أطل عبر شخصية «عم شكشك» ضمن فريق «مسرح مصر» التي لاقت تجاوباً جماهيرياً لافتاً، وصارت الأشهر بين تلك العروض، ما أدى إلى تحويلها إلى برنامج يحمل اسم «شكشك شو». عن هذه التجربة يقول خاطر ل «الحياة»: «نظراً للنجاح الذي حققته الشخصية اقترحت مجموعة قنوات «أم بي سي» تحويلها إلى برنامج كوميدي، وهو ما استقبلته بمزيج من الحماسة والخوف لكونها تجربتي الأولى من دون مشاركة أحد من النجوم». وعن الاتهامات التي لاحقته بسرقة الشخصية، يقول: «لا تمت بأي صلة لشخصية «عم شكشك» التحريكية التي قدمها المخرج الراحل رحمي عبر مسلسل الأطفال «بوجي وطمطم»، وكان مقرراً للشخصية التي جسدتها أن تحمل اسم «عم هالالا»، وهو الاسم الوارد في نص المسرحية، ولكن خلال أول العروض التي ظهرت من ضمنها الشخصية عبر «التواصل الاجتماعي» وجدت زملائي في المسرح يطلقون عليها اسم «عم شكشك» على سبيل السخرية نظراً للتشابه معه حين يطل من نافذة منزله، ما دفع القائمين على العمل لتغيير الاسم من دون قصد لاستغلال الشخصية الكارتونية المعروفة». وينفي خاطر الإشاعات التي تقول إنه أنهى مسيرته الفنية ضمن فريق «مسرح مصر»، مؤكداً توقيعه بطولة الموسم الجديد المقرر عرضه خلال موسم عيد الفطر المقبل، واصفاً المسرح ب «عشقه الأول» وفي الوقت ذاته بأنه «الأصعب على الإطلاق». وعن مشاريعه، يقول: «أشارك في فيلم «طلق صناعي» أمام ماجد الكدواني وسيد رجب ومي كساب وبيومي فؤاد وعبد الرحمن أبو زهرة، كما أنتظر عرض فيلم «هبوط اضطراري» بمشاركة أحمد السقا وأحمد زاهر. وعلى صعيد الدراما، أشارك في موسم رمضان 2017 عبر مسلسل «هربانة منها» أمام النجمة ياسمين عبدالعزيز».