تقوم رئاسة شؤون الحرمين بغسل وتعقيم صحن المطاف ومداخله 3 مرات، بين صلاتي العشاء والفجر، بطريقة مركزة، حرصا على سلامة قاصدي المسجد الحرام، وضمانا للقضاء على جميع الفيروسات والمكروبات المنتشرة على الأرض وأسطح الأدوات المستخدمة داخل صحن المطاف. وتعمل الإدارة العامة للشؤون الفنية والخدمية التابعة لوكالة الرئاسة العامة للشؤون الفنية والخدمية، ممثلةً في إدارة التطهير والسجاد، بغسل وتعقيم وتعطير صحن المطاف 7 مرات يوميا، 3 مرات منها تكون خلال الفترة بين صلاة العشاء وصلاة الفجر، إذ تبدأ عملية الغسل الأولى بعد الانتهاء من صلاة العشاء مباشرة يقوم بها 140 موظفا وعامل نظافة، موزعين على عدد من المهام، والتي تبدأ برفع السجاد من الأماكن المخصصة للصلاة، والمشايات البلاستيكية المخصصة للمرات لتنظيفها وتعقيمها، ثم تُغسل مداخل الصحن وأرضيته وتعقم وتعطر بطريقة مركزة، كما تتم عملية غسل وتعقيم جميع الأدوات المستخدمة في صحن المطاف، من بينها دواليب المصاحف، والحواجز الأمنية، ودرابزين السلالم، التي تضمن تعقيمها 100%، ثم يعاد فرش السجاد والمشايات البلاستيكية، ليتم التأكد من نظافتها وتعقيمها وتعطيرها، وتنتهي هذه العملية منتصف الليل، لتعاد عملية الغسيل والتعقيم والتعطير مرتين بالآلية الأولى نفسها، لتنتهي آخر عملية قبل موعد صلاة الفجر بساعة. تيقن تتم عمليتا الغسيل الثانية والثالثة، للتأكد من ضمان نظافة وتعقيم صحن المطاف، لسلامة قاصدي وزوار المسجد الحرام، وتتم عمليات الغسيل والتعقيم بعناية خاصة، ويركز فيهما على عمليات التعقيم بالرش، لعدم وجود زوار داخل صحن المطاف، لتصل عدد عمليات الغسيل والتعقيم إلى 7 مرات موزعة على كامل اليوم، يقوم بها حوالي 330 موظفًا وعاملا، و10 مكائن لكل وردية.