تكثف وكالة المسجد النبوي أعمال التعقيم والتطهير وتهيئة الحرم الشريف من خلال الجهود اليومية التي تقوم بها إدارة التطهير التابعة للإدارة العامة للشؤون الخدمية لضمان سلامة الزائرين والمصلين وحفاظاً على استمرار تعقيم الأرضيات الخاصة بمواقع الزيارة والصلاة، حيث يتم تعقيم المصليات داخل أروقة المسجد النبوي من خلال أجهزة التعقيم الحديثة وبمواد ذات فاعلية في تعقيم الأسطح والأرضيات والممرات والأبواب من الداخل بما يسهم في توفير جو صحي وبيئة آمنة، توفر الإدارة البراميل الخاصة بالنفايات، وصناديق الأحذية، وأيضًا استخدام المعقمات لتعقيم وتطهير ساحات باب السلام والبقيع وباب النساء بكمية بلغت 6300 لتر وبعدد 15 معدة خاصة بالتعقيم والتطهير ، كما يتم توفير كمية الأكياس الخاصة بحفظ الأحذية والتي تبلغ 18000 كيس بما يعادل 20 لفة في اليوم الواحد، وتستخدم الإدارة 52 مكينة لغسيل أرضيات الساحات والمواقف والتوسعات يومياً، وكذلك غسيل وتعقيم الارضيات داخل الحرم الشريف والتوسعات والساحات الخارجية 10 مرات يومياً من خلال ماكينات خاصة ومزودة بتعقيم وتطهير الأرضيات، كما تقوم الإدارة بتأمين المكانس الكهربائية لكنس السجاد والتي يبلغ عددها 200 مكنسة على مدار الساعة، فيما يبلغ عدد الدواليب الخاصة بالأحذية التي يتم تنظيفها وتعقيمها 2600 دولاب، كما يتم توفير كراسي لكبار السن يتم توزيعها على مداخل المسجد النبوي والتوسعات وأقسام النساء حيث يبلغ عددها 10000 كرسي تقريباً.