حصل طلاب النادي العلمي بينبع على مراكز متقدمة محليا ودوليا حيث حقق الطلاب المشاركون المراكز الأول والرابع والخامس على مستوى المملكة في الأولمبياد الوطني للإبداع العلمي وعلى مستوى العالم كان لفريق الأولمبياد العلمي بمدرسة ابن خلدون الثانوية شرف تمثيل المملكة في الملتقى العلمي الثالث عشر بدولة سلوفاكيا ESI 2011 ضمن وفد وزارة التربية والتعليم وحقق الطلاب المشاركون إنجازا عالميا بحصولهم على ميداليات التميز وشهادات الدبلوم في الابتكارات العلمية بالملتقى العلمي العالمي الثالث عشر بسلوفاكيا ESI 2011 وذكر مدير إدارة التربية والتعليم محمد فراج يعتبر النادي العلمي أحد الأنشطة المدرسية التي تقام بمدارس المحافظة وتقوم بتوفير بيئة علمية لممارسة بعض الأنشطة العلمية التي تنمي مهارات الطلاب واكتشاف مواهبهم وميولهم العلمية في مختلف المجالات العلمية منها الكيمياء والفيزياء والأحياء، مضيفا أن الإدارة في انتظار اعتماد مبنى خاص ومستقل للنادي العلمي في حي البندر، كما يهتم هذا النادي العلمي بمسابقة أولمبياد الإبداع العلمي في مسار الابتكار الذي حقق الطلاب من خلاله المركز الأول والرابع والخامس على مستوى المملكة العربية السعودية للمرحلة الدولية، وحيث تشرف شعبة النشاط العلمي بالإدارة على التخطيط والإشراف على تنفيذ برامج النشاط العلمي على مستوى الإدارة، ومتابعة تنفيذ البرامج على مستوى المدارس ويمكن تصنيف برامج النشاط العلمي في عدة مجالات منها مجال المسابقات العلمية والدورات العلمية والتثقيف العلمي والزيارات والرحلات العلمية: زيارة المواقع العلمية والرحلات الجيولوجية، وأيضا يتم تنفيذ بعض البرامج على المستوى المحلي والدولي مثل أولمبياد الإبداع العلمي والمسابقات الوطنية في الرياضيات والفيزياء وأسبوع الفضاء العالمي وبرنامج جلوب البيئي العالمي.