يعد مجمع الملك عبدالعزيز للمكتبات الوقفية بالمدينةالمنورة المشروع الأهم الذي يجمع مكتبات ثقافية ووقفية تحت سقف واحد، ويضم 150 ألف كتاب ومخطوطة نادرة، للتيسير والتسهيل على المختصين والمهتمين والباحثين في جمع المعلومات من المصادر الموثوقة التي احتفظت بها تلك المكتبات على مر الأزمنة، ويعيد لها الدور الريادي الكبير في رفد حركة العلم، وإعادة الحراك الثقافي وفق الإمكانيات التقنية والفنية العالية التي وُضعت بين يدي المثقفين والمؤرخين والعلماء وطلاب العلم في شتى المجالات. أشهر المكتبات الوقفية ويضم المجمع مجموعةَ من أشهر المكتبات الوقفية في العالم، من أبرزها مكتبة المصحف الشريف ومكتبة الشيخ عارف حكمت والتي أشتهرت عالميًا منذ أن كانت جنوب الحرم النبوي الشريف قبل التوسعات واستمرت العناية بها والحفاظ على ممتلكاتها وإتاحتها للباحثين دون توقف، والمكتبة المحمودية، ومكتبة المدينةالمنورة العامة، ومكتبات مدارس: الإحسائية، والساقزلي، والشفاء، والعرفانية، والقازانية، وكيلي ناظري، إضافة إلى مكتبات: رباط الجبرت، ورباط سيدنا عثمان رضي الله عنه، ورباط قرة قرة باش، ورباط بشير أغا، ومكتبات لبعض علماء المدينةالمنورة أمثال الشيخ محمد ابراهيم الختني، والشيخ عبدالقادر شلبي، والشيخ عبدالرحمن الصافي. أقدم المصاحف كما أن المجمع يفخر بمكتبة المصحف الشريف التي تحوي (1878) مصحفًا مخطوطًا، و(84) ربعةً قرآنية نادرة.. ويعود تاريخ أقدم مصحف إلى العام 488ه، وهو بخط علي بن محمد البطليوسي، وقد كتب على رق الغزال، ويتلوه مصحف كتب عام 549 ه وهو بخط أبي سعد محمد إسماعيل بن محمد وأهدي عام 1253ه. ومن مخطوطات المصاحف المتميزة بالمجمع مصحف مخطوط بخط غلام محي الدين سنة 1240ه، وهناك خزانات ذات قيمة تاريخية أهديت للمجمع في فترات تمثل قيمة فنية وتاريخية، أيضًا مصحف أهداه السلطان قايتباي وهو يمثل تحفة في مجال الخط العربي وفنونه وجماليات الألوان وسيقوم المجمع بعمل دراسة تحليلية فنية تاريخية له إضافة لمصاحف كثر متاحة لطلبة العلم والباحثين. مخطوطات نادرة كما يضم المجمع مخطوطات نادرة يبلغ عددها (15722) مخطوطًا أصيلاً، بالإضافة إلى المصوراتِ على وسائطَ متنوعة، كما يضم (25000) من الكتب النادرة، وما يقرب من (100000) كتابٍ مطبوع كانت تمثل المكتبة العامة مع باقي أنواع المصادر، كما يمتلك المجمع مجموعة متميزة من اللوحات، ويضم المجمع محتويات مكتبة الملك عبدالعزيز بالمدينةالمنورة، والمكتبات الوقفية الأخرى، والتي لدى الأهالي، وتضم مكتبة الملك عبدالعزيز التي ستنقل بجميع محتوياتها للمجمع بين جنباتها ما يقارب ألفي مصحف مخطوط حوتها مكتبة المصحف الشريف، بالإضافة إلى نحو 14 ألف مخطوط أصلي. مجمع المكتبات في أرقام ألف محتوى متنوع مكتبة وقفية ألف مخطوطة ألف كتاب نادر قطعة أثرية مصحفًا مخطوطًا