يحوي الطابق الأرضي من البرج الطبي، الذي تبلغ مساحته 4620 متراً مربعاً، مكتباً للاستعلامات العامة، واستراحات للرجال والنساء، ومحالاً للهدايا والزهور، إضافة إلى قسم العيادات الخارجية، البالغ عددها 38 عيادة لجميع التخصصات الطبية، وقسم المناظير، والأشعة، الذي يتكون من غرفتي أشعة عادية، وأخرى للأشعة المقطعية، بخلاف غرفة أشعة احتياط. كما يضم صيدلية مركزية جهزت بأحدث الحاويات والثلاجات لحفظ الأدوية، إذ تم ربطها مع الأقسام الأخرى بشبكة داخلية، لسهولة تغطية حاجات هذه الأقسام من الأدوية والعقاقير الطبية. ويضم أيضاً وحدة لتفتيت الحصوات في الكلى من دون تدخل جراحي. أما الطابق الأول، الذي تبلغ مساحته 4623 متراً مربعاً، فيتكون من قسم العمليات، الذي يضم تسع غرف مزودة بتكنولوجيا متقدمة في مجال تجهيز غرف العمليات، إضافة إلى غرف التخدير والإفاقة الإنعاش، والخدمات المختلفة داخل القسم، ووحدة العناية المركزة الحالات الحرجة، التي روعي في تصميمها الثقافة الشرقية، والراحة النفسية للمريض، بما يخلق نوعاً من الود بين المريض ومكان العلاج. وتتكون الوحدة من 36 سريراً للعناية الطبية الفائقة في التخصصات كافة، إضافة إلى وحدات معاونة متكاملة لخدمة مرضى الحالات الحرجة. كما يضم الطابق وحدة لعلاج الحروق تُعد من الوحدات الحديثة والمتخصصة في علاج جميع أنواع الحروق، بدرجاتها المختلفة، إذ جهزت الوحدة تجهيزاً خاصاً وفق أحدث ما وصل إليه الطب في هذا التخصص. كما يضم مكاتب الأطباء والاستشاريين، وغرفاً للاجتماعات متعددة الاستخدامات، وقاعة للتعليم المستمر. ويضم الطابق الثاني من البرج، وتبلغ مساحته 1728 متراً مربعاً، المختبر الرئيس، الذي جهز بأحدث أجهزة التحاليل الطبية التي تخدم جميع أقسام البرج، كما يوجد مختبر صغير للتحاليل البسيطة، وأخذ العينات في قسم العيادات في الطابق الأرضي، ومطاعم العاملين والزائرين، والمكتبة الطبية المزودة بأحدث الكتب والمراجع الطبية وقاعات المطالعة، كما زودت بشبكة إلكترونية يستطيع الباحث من خلالها التواصل مع الجامعات والمعاهد الطبية والمستشفيات، في جميع أنحاء العالم لمعرفة آخر ما وصلت إليه تقنيات العلاج. ويشمل الطابق أيضاً قاعات متعددة لأغراض التعليم، وربطت هذه القاعات إلكترونياً ببعض الأقسام المهمة في البرج، مثل جناح العمليات لتدريب الأطباء الجُدد، أو نقل العمليات للمؤتمرات أو المحاضرات والتدريس، إضافة إلى المكاتب الإدارية والفنية المختلفة، واستراحات للأطباء. أما الطوابق من الثالث إلى السادس من البرج، وتبلغ مساحتها الكلية 6912 متراً مربعاً، فخصص الثالث والرابع منها لتنويم الرجال، والخامس والسادس لتنويم النساء، ويضم كل طابق منها غرفاً للعناية المركزة والمتوسطة، وأخرى للعزل، وغرفاً للأطباء والتمريض ومحطات التمريض. ويشمل الطابق السابع الذي يطل على مدينة الدمام، قاعة لكبار الزوار.