يعتقد البعض أن مسمى «أبيار علي» وهو ميقات أهل المدينة يرجع إلى الخليفة علي بن أبي طالب رضي الله عنه، ويرى آخرون أن المسمى يرجع إلى سلطان دارفور علي بن دينار والذي حضر إلى الميقات عام 1898م حاجا، فحفر الآبار للحجاج، كما جدد مسجد ميقات ذي الحليفة، فيما تقول روايات شعبية يتواردها أهل المنطقة إن شخصا قدم إلى الميقات يدعى «علي» فحفر الآبار. وأوضح الباحث في تاريخ المدينةالمنورة الدكتور تنيضب عوادة الفايدي، أن الأسباب في تسمية أبيار علي بذلك غير معروفة، قائلا: هناك عدد نسب المسمى إلى علي بن أبي طالب رضي الله عنه منهم العلامة جمال الدين يوسف بن المجاور الشيباني في كتابه «تاريخ المستبصر»، والعلامة علي بن الحسن الخزرجي في تاريخه «العقود اللؤلؤية في تاريخ الدولة الرسولية»، والعلامة السيد محمد كبريت الحسيني المدني في كتابه «الجواهر الثمينة في محاسن المدينة»، والسيد جعفر بن إسماعيل البرزنجي مفتي الشافعية في كتابه «نزهة الناظرين في تاريخ مسجد سيد الأولين والآخرين». وأضاف: ينسب البعض المسمى لعلي بن أبي طالب رضي الله عنه لظنهم أنه قاتل الجن بها، وهذا لا صحة له، إذ نفى تلك المقولة شيخ الإسلام ابن تيمية رحمه الله. وأشار إلى أن القول الثاني والذي يقول بأن تسميتها بأبيار علي راجع إلى علي بن دينار سلطان دارفور لا صحة له، إذ تقول الروايات أنه وأثناء مروره في المنطقة لأداء الحج وجدها في حالة سيئة فحفر الآبار، ولكن ما يدلل على عدم صحة الرواية هي وفاته عام 1335ه، لأن مسمى أبيار علي أشار إليه ابن تيمية المتوفى 728ه، بقوله «فذو الحليفة: هي أبعد المواقيت، بينها وبين مكة عشر مراحل أو أقل أو أكثر بحسب اختلاف الطرق، فإن منها إلى مكة عدة طرق وتسمى وادي العقيق ومسجدها يسمى مسجد الشجرة، وفيها بئر، تسميها جهال العامة بئر علي -لظنهم أن عليا قاتل الجن بها-»، وكما قال المطري المتوفى عام 741ه: «ثم يأتي على غربي جبل عير ويصل إلى بئر علي ذي الحليفة محرم الحاج». وقال الجزيري عام 977ه: «ثم يرحل إلى ذي الحليفة ويسميه الحاج بئر علي وهو ميقات الحج الشامي ومن مر على المدينة». وأبان أن ذا الحليفة باتت اليوم داخل المدينةالمنورة، وتعتبر أبعد المواقيت عن مكةالمكرمة، وقد ذكر المؤرخون وجود مسجد في ذي الحليفة وهو «مسجد الميقات» في عهد الرسول صلى الله عليه وسلم استنادا إلى حديث عبدالله بن عمر رضي الله عنه، فعن عبدالله بن عمر رضي الله عنهما: «أن رسول الله صلى الله عليه وسلم كان يخرج من طريق الشجرة ويدخل من طريق المعرس، وأن رسول الله صلى الله عليه وسلم كان إذا خرج إلى مكة يصلي في مسجد الشجرة، وإذا رجع صلى بذي الحليفة ببطن، وبات حتى يصبح»، قائلا كلمة «مسجد الشجرة» دليل وجود المسجد في عهده صلى الله عليه وسلم ولم تذكر آبار في ذلك التاريخ أو يرتبط المسجد بمسمى أي بئر سواء لعلي رضي الله عنه أو غيره. وذكر الدكتور الفايدي، أن الموقع ارتبط بعدة أسماء ك«ذي الحليفة» نسبة إلى نبات الحلفاء، ويقال: المسمى جاء لوقوعه في منطقة ذي الحليفة وهو اسم ماء، أما مسجد الشجرة: فجاءت تسميته لأن النبي صلى الله عليه وسلم كان ينزل تحتها ويستظل بها، كما سمي بمسجد الميقات: لكونه ميقات أهل المدينةالمنورة ومن يمر بها. «عكاظ» تجولت في منطقة آبار علي ورصدت بعض الشواهد، إذ تبين أن المنطقة باتت تشكل خطرا على السكان نتيجة إهمال الآبار، حيث إن إحدى الآبار لم تغلق فوهتها جيدا رغم وقوعها في طريق يؤدي إلى مسجد، كما غطيت فوهات آبار أخرى بقطع خشبية متهالكة.