تعتزم جامعة الملك فيصل تقديم برامج الدراسات العليا في الفصل الدراسي الاول من العام الدراسي 1424-1425ه وذلك في الكليات التالية: كلية الطب بالدمام, الدكتوراة في علم وظائف الاعضاء والماجستير في التخصصات التالية: التشريح الكيمياء الحيوية علم وظائف الاعضاء هذا الى جانب الزمالات المتعددة في التخصصات الطبية الاخرى. اما برامج كلية العلوم الزراعية لدرجة الماجستير فانها تشمل علوم الاغذية وتقنيتها والاراضي والمياه والهندسة الزراعية ووقاية النبات والاقتصاد المنزلي (غذاء وتغذية واقتصاد منزلي تربوي - للبنات فقط) كما تقدم كلية التربية دبلوما في التوجيه والارشاد للبنين والبنات اما كلية الطب البيطري والثروة الحيوانية فسوف تقدم برامج الماجستير في التخصصات التالية: ماجستير في التشريح والتناسليات وصحة الحيوان (طب وقائي) اما كلية العمارة والتخطيط الحضري والاقليمي فسوف تطرح برامج الماجستير في علوم وتقنية البناء في عمارة البيئة وقد سبق الاعلان عن هذه البرامج في وقت مبكر من هذا العام علما بان كليات الجامعة تقدم ما مجموعه 44 برنامجا تشمل الدكتوراة والماجستير والدبلوم والزمالات الطبية.