أنشئ القسم النسوي بالجامعة في بداية العام 1431ه بقرار من المجلس الأعلى للجامعة برئاسة صاحب السمو الملكي الأمير نايف بن عبدالعزيز "رحمه الله" استجابة للحاجة إلى وجود كوادر نسائية مؤهلة في مجال الدراسات العليا المتخصصة في مجال العلوم الأمنية وكذلك إدراكاً من الجامعة لأهمية الدور الذي تؤديه المرأة في المجتمع حيث أتيح المجال للمرأة للالتحاق ببرامج الجامعة في عدد من تخصصات الدراسات العليا المناسبة سعياً نحو التوسع في ترسيخ مفهوم الأمن الشامل الذي تتبناه الجامعة تنفيذاً للتوجيهات الكريمة من أصحاب السمو والمعالي وزراء الداخلية العرب وبمتابعة دائمة من صاحب السمو الملكي الأمير محمد بن نايف بن عبدالعزيز وزير الداخلية ورئيس المجلس الاعلى للجامعة الذي يتكون من نخبة من أصحاب الخبرة العلمية والامنية من الدول العربية. ويهدف القسم النسوي بالجامعة بشكل رئيس إلى إثراء البحث العلمي في مجالات الدراسة الأمنية والإستراتيجية وتقديم الاستشارات العلمية ورفد المكتبة العربية بالأبحاث والدراسات المتخصصة، والإسهام في تنمية الحس الأمني لدى الطالبات الملتحقات بهذا القسم بما يخدم قضايا التنمية المستدامة ودعم البحث العلمي في المجالات الاجتماعية والإدارية ،وإتاحة الفرصة للمرأة للتخصص في الدراسات العليا في الميادين الأمنية المختلفة التي تعمل بها وتكوين جيل من الباحثات والممارسات في مجال العلوم الإدارية والاجتماعية من منظور الأمن الشامل القادر على التعامل بأسلوب التفكير العلمي ووضع الاستراتيجيات وتحسين الأوضاع الاجتماعية والإدارية في مجتمعاتهم إضافة إلى تزويد العاملات بالمختبرات الجنائية العربية بالمعارف والمهارات الفنية اللازمة من خلال البرامج التدريبية والتطبيقية. وقد بدأت الدراسة في القسم النسوي عام 1431ه الموافق 2010م في كلية الدراسات العليا حيث تم القبول في هذه المرحلة بقسم العلوم الإدارية الذي يمنح (الماجستير في العلوم الإدارية) وقسم العلوم الاجتماعية الذي يمنح الماجستير في العلوم الاجتماعية(الإصلاح والتأهيل )و( الرعاية والصحة النفسية). كما تم القبول في كلية علوم الأدلة الجنائية لدرجة الماجستير للنساء في المختبرات الجنائية في أقسام (الكيمياء الحيوية ، وقسم الأحياء الجنائية ، وقسم البصمة الوراثية وقسم السموم والمخدرات)،كما أن الجامعة بدأت اعتباراً من العام الدراسي 2012م قبول المتقدمات لمرحلة الدكتوراه في عدد من التخصصات بكلية الدراسات العليا بأقسام العدالة الجنائية والعلوم الاجتماعية والعلوم الإدارية.