أصدر الشيخ خليفة بن زايد آل نهيان رئيس دولة الإمارات مرسوما اتحاديا رقم 98 لسنة 2009 بإنشاء "مجلس شؤون الحدود وتشكيله واختصاصاته " برئاسة الشيخ محمد بن زايد آل نهيان ولي عهد أبوظبي نائب القائد الأعلى للقوات المسلحة الاماراتية. ويعتبر " مجلس شؤون الحدود " بموجب المرسوم الجهة الرسمية في الإمارات المختصة والمخولة بمعالجة قضايا الحدود. ونص هذا المرسوم على إلغاء المرسوم الاتحادي رقم 71 لسنة 1999 بشأن تشكيل واختصاصات اللجنة الدائمة للحدود والمراسيم المعدلة له وتؤول للمجلس كافة أصول اللجنة الدائمة للحدود والتزاماتها وحقوقها والاعتمادات المالية التي خصصت لها.