قالت جمعية الأطباء النفسيين الأمريكي بأن العلاج السلوكي - المعرفي مفيد جداً في علاج الاضطرابات النفسية لدى الأطفال، خاصةً اضطرابات القلق التي تكون أكثر انتشاراً في مرحلة الطفولة. وقالت الجمعية الأمريكية بأن العلاج السلوكي المعرفي مفيد جداً في علاج الرُهاب بكافة أنواعه ؛ الرهُاب البسيط أو الرُهاب المُحدد مثل الخوف المرضى من الظلام أو من الحيوانات الأليفة التي تعيش في المنزل، وكذلك الرُهاب الاجتماعي والذي يُشكلّ أحد الاضطرابات الرئيسة في سن الطفولة، حيث قالت الجمعية بأن علاج الأطفال بواسطة اختصاصي نفسي أو طبيب نفسي مُتمرس وذي خبرة في العلاج السلوكي المعرفي قد يُساعد الأطفال على التغلّب على الرُهاب الاجتماعي في سن الطفولة قبل أن يصل إلى مرحلة المراهقة أو أن يستمر معه بعد أن يُصبح بالغاً. والعلاج السلوكي المعرفي أيضاً مفيد في علاج اضطراب قلق الانفصال والذي يحدث كثيراً عند بعض الأطفال في بداية سنوات الدراسة الأولى عند الافتراق عن والدته وبيته. وكذلك فإن العلاج السلوكي المعرفي قد يكون فعالاً بدون مساعدة أي أدوية نفسية سواء المضادة للاكتئاب أو المضادة للقلق. وشددت الجمعية على أن يتم توخي الحذر عند وصف الأدوية النفسية للأطفال إلا عند الضرورة القصوى.