يحظى جمرك ميناء ضباء بدعم متواصل من مصلحة الجمارك باعتباره من المنافذ الجمركية الهامة على حدود المملكة البحرية على البحر الأحمر حيث تجري الأعمال التطويرية بالجمرك بشكل مستمر لإحداث نقلة نوعية في أسلوب الخدمة الجمركية للمتعاملين مع الجمرك والتيسير عليهم. وأوضح مدير عام الجمرك علي بن سلمان العطوي أن مصلحة الجمارك قامت بتنفيذ عدة مشاريع طموحة في جمرك ميناء ضباء ومنها توريد وتركيب أحدث ما توصلت إليه التقنية العالمية من أجهزة الفحص الإشعاعي التي ستسهم بإذن الله في سرعة ودقة إنهاء إجراءات المسافرين ومنها نظام فحص الحاويات والشاحنات بالأشعة السينية المتطورة وتوفير عدد من أجهزة فحص حقائب وأمتعة المسافرين. وقال إنه جاري تنفيذ مشروع نظام فحص سيارات الركاب بالأشعة حيث يتم بواسطته التأكد من محتويات كافة أجزاء السيارة في مدة وجيزة مما يوفر الراحة للمسافرين وسيتم إدخال هذا النظام مع نهاية هذا العام 1431ه // مشيرا إلى أنه تم الانتهاء من تنفيذ المبنى الإداري الحديث بجمرك الميناء والمكون من ثلاثة أدوار وتم افتتاحه من أجل تأدية الأعمال والواجبات بكل راحة على مدار الساعة من قبل منسوبي الجمرك.