على الرغم من عمرها القصير نسبيًا إلا أن جامعة طيبة دخلت سباقًا مبكرًا مع نظيراتها السعودية والعربية.، تستند في ذلك إلى مواكبة الحاضر واستشراف المستقبل استجابة للثوابت والمتغيرات، وتعمل الجامعة على بناء شراكة حقيقية مع المجتمع لتقديم أنموذج جديد، ينسجم مع كيفية تنظيم وإدارة تمويل التعليم الجامعي، وتعزيز قدرات هيئة التدريس الأكاديمية والبحثية، وقدرات العاملين والإداريين ونظم المعلومات والتقنية. في عام 1424ه صدر الأمر السامي الكريم القاضي بالموافقة على قرار مجلس التعليم العالي القاضي بدمج فرعي (جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية وجامعة الملك عبدالعزيز في المدينةالمنورة) ليكونا جامعة مستقلة مقرها منطقة المدينةالمنورة. وصدر القرار السامي الكريم بتاريخ 19/4/1425ه القاضي بتسمية الجامعة باسم جامعة طيبة. وتؤكد الجامعة على أهمية التطوير باستمرار للارتقاء بجودة بيئة مجتمع التعليم لدعم عملية التدريس، والبحث العلمي، وخدمة المجتمع، بالتكامل بين مختلف العلوم والآداب، من خلال برامج دراسية وبحثية متطورة لإعداد مواطن منتج قادر على المنافسة والإبداع. وتسعى الجامعة لاستثمار مواردها البشرية واكتشاف الموهوبين من منسوبيها ورعايتهم لدعم الاقتصاد الوطني، وتطبيق التعليم عن بعد تشجيعًا للتعليم المستمر لمقابلة الطلب المتزايد على التعليم الجامعي، بما يواكب عهد الفضائيات والعولمة وتطورات القرن الواحد والعشرين. وتضم الجامعة خمس وكالات هي وكالة الجامعة، وكالة الجامعة للتطوير والجودة، وكالة الجامعة للدراسات العليا، وكالة الجامعة للشؤون التعليمية ووكالة الجامعة للفروع. وتضم العمادات المساندة عمادة البحث العلمي وعمادة التطوير الجامعي وعمادة التعليم الموازي والمستمر وعمادة التعليم عن بعد وعمادة الجودة وعمادة الخدمات التعليمية وعمادة شؤون المكتبات وعمادة شؤون هيئة أعضاء التدريس وعمادة تقنية المعلومات وعمادة القبول والتسجيل وعمادة الدراسات الجامعية للطالبات. كما تضم ثلاثة مراكز هي المركز الإعلامي ومركز اللغة الانجليزية ومركز النشر. أما الكليات فتضم كلية الآداب والعلوم الإنسانية، وكلية التربية، وكليات الطب والصيدلة والعلوم والعلوم التطبيقية والهندسة وطب الإنسان وهندسة الحاسبات والعلوم الصحية وعلوم الأسرة والمجتمع بالإضافة إلى معهد عالٍ للأئمة والخطباء ويبلغ عدد الطلاب والطالبات ما يزيد عن (60) ستين ألف طالب وطالبة في المدينةالمنورة ومحافظاتها. ولجامعة طيبة جهد إعلامي مميز تقوم به مجلتها رسالة طيبة، بتقديم إعلام متطور مهنيًا وفكريًا من خلال تنويع المادة الإعلانية المنشورة وكذلك العمل على توسيع نطاق المشاركة. أما رسالتها فهي الإسهام في بناء مشروع إعلامي جامعي صادق للنهوض بالشباب نحو الرقي والحضارة المتزنة. وتسعى رسالة جامعة طيبة من خلال عملها إلى تحقيق خمسة أهداف رئيسية هي إثراء الثقافة العامة وترسيخ القيم والأخلاق الإسلامية، وتقوية روابط الوحدة والانتماء الوطني والعربي والإسلامي، وتوسيع دائرة الوعي من أجل العمل على إحداث التطور داخل الجامعة، وإعطاء الفرصة للجميع للتعبير عن رأيهم بحرية وثقة صادقة، وبناء شخصيات الطلاب والطالبات المشاركين في الرسالة. وهناك أيضًا مجلة جامعة طيبة للعلوم، وهى مجلة نصف سنوية في مجالات العلوم الأساسية، وتشهد الجامعة حاليًا تنفيذ عدد من المشروعات تتمثل في مبانٍ دراسية وإدارية بالإضافة إلى استكمال البنية التحتية والتي تنفذها شركات وطنية كبرى ومن المتوقع أن تنتهى الجامعة من 75% من مشاريعها خلال الثلاث سنوات المقبلة.