يتألف المجلس الأعلى للقوات المسلحة من قادة الفروع العسكرية الرئيسية في الجيش المصري برئاسة وزير الدفاع القائد العام للقوات المسلحة المشير محمد حسين طنطاوي. ويعد رئيس الجمهورية بحكم منصبه قائدا أعلى للقوات المسلحة، بيد أن تنحي مبارك وتكليف المجلس الأعلى يعني أنه برئاسة المشير طنطاوي بوصفه قائدا عاما لهذه القوات. وأبرز أعضاء هذا المجلس هم: * المشير محمد حسين طنطاوي وهو القائد العام للقوات المسلحة ووزير الدفاع والإنتاج الحربي. ولد عام 1935 من أب مصري نوبي، تخرج في الكلية الحربية 1956. رقي إلى رتبة مشير عام 1993. تم اختياره وزيرا للدفاع والإنتاج الحربي وقائدا عاما للقوات المسلحة في 31 ديسمبر 2005. * الفريق سامي عنان وهو رئيس أركان القوات المسلحة، ولد عام 1948. عمل قائدا لكتيبة صواريخ عام 1981، كما تولى منصب قائد قوات الدفاع الجوي حتى 2005. وكان قد عين قائدا لقوات الدفاع الجوي في يوليو من العام 2001. * الفريق طيار رضا حافظ يشغل الفريق طيار رضا محمود حافظ منصب قائد القوات الجوية وهو من مواليد 1952، تخرج في الكلية الجوية 1972 وشارك في السنة التالية مباشرة في حرب أكتوبر 1973. وهو يشغل منصب قائد القوات الجوية منذ عام 2008. * الفريق عبدالعزيز سيف الدين يشغل الفريق أركان حرب عبدالعزيز سيف الدين منصب قائد الدفاع الجوي. ولد عام 1949، وهو خريج الدفعة 70 في الكلية الحربية، اشترك في حربي الاستنزاف وأكتوبر 1973. * الفريق مهاب مميش يشغل الفريق بحري مهاب محمد حسين مميش منصب قائد القوات البحرية منذ عام 2007. وتعد القوة البحرية أصغر فرع في الجيش المصري، ومهامها حماية السواحل وتأمين سلامة الملاحة في قناة السويس.