لقد تتلمذ جابر بن حيان الأزدي على مؤلفات خالد بن يزيد بن معاوية، وطبق أغلب أفكاره العلمية الهامة، ونفذ بكل دقة وإمعان توصياته المتعلقة بتطبيق التجارب العلمية المخبرية على مفردات العلوم التطبيقية المعدة للدراسة. وعن طريق عمله هذا تمكن من التوصل إلى أن التجربة العلمية التي تعتبر أهم مراحل العمل العلمي، لذا أطلق عليه مؤسس الكيمياء الحديثة. أما أستاذه الحقيقي فهو الإمام جعفر الصادق الذي غرس في نفسه الصدق والأمانة والتفاني في العمل، لذا كثيرا ما يرد اسمه في مؤلفات جابر بن حيان. ويذكر محمد يحيى الهاشمي في كتابه الكيمياء في التفكير الإسلامي نقلاً عن أ.ج. هولميارد في نشراته بالجمعية الطبية الملكية البريطانية عن جابر بن حيان " أن جابراً هو تلميذ جعفر الصادق وصديقه، وقد وجد في إمامه الفذ سنداً ومعيناً ومرشداً أميناً، وموجهاً لا يستغني عنه. وقد سعى جابر بن حيان لأن يحرر الكيمياء بإرشاد أستاذه من أساطير الأولين التي علقت بها في الأسكندرية، فنجح في هذا السبيل إلى حد بعيد. من أجل ذلك يجب أن يقرن اسم جابر مع أساطين هذا الفن في العالم أمثال بويله وبريستله ولافوازيه وغيرهم من الأعلام". كان جابر بن حيان الأزدي من طلاب العلم المخلصين لأساتذتهم، حيث كان يحث طلابه على احترام أساتذتهم والمثابرة على البحث العلمي الدقيق وتطبيق التجارب العلمية المخبرية متى أمكن ذلك. ويظهر ذلك واضح المعالم مما يقوله في كتابه كتاب البحث- المقالة الأولى " فأما ما يجب للأستاذ على التلميذ فهو أن يكون التلميذ لينا قبولاً لجميع أقاويله من جميع جوانبه، لا يعترض عليه في أمر من الأمور، وان كان كافيا متصوراً للأمر، فإن ذخائر الأستاذ العالم ليس يظهرها للتلميذ إلا عند السكون إليه والاحماد له غاية الاحماد. وذلك أن منزلة الأستاذ منزلة العلم نفسه، ومخالف العلم مخالف الصواب، ومخالف الصواب حاصل في الخطأ والغلط. وهذا لا يؤثره عاقل. وأيضاً فإن التلميذ متى لم يكن للأستاذ على هذا المقدار من المطاوعة أعطاه الأستاذ قشور العلم وظاهره، والشيء الذي يقال له العلم الخارج والبراني". ويقال: انه سمي جابراً لأنه هو الذي جبر العلم، أي أعاد تنظيمه، ولقب بالكوفي لأنه قضى مع عائلته مدة طويلة من حياته في مدينة الكوفة بالعراق. ولكنه اشتهر لدى المؤرخين للعلوم في المعمورة بلقب الأزدي لأنه من قبيلة الأزد المشهورة بين القبائل العربية. ويقول سيد حسين نصر في كتابه العلوم والحضارة في الإسلام " ان عائلة جابر بن حيان جاءت من جنوب الجزيرة العربية إلى الكوفة، وعندما كبر جابر بن حيان، هاجر إلى بغداد، حيث شاع صيته بين علماء الكيمياء آنذاك".