هناك مضاعفات كثيرة تحدث نتيجة لعدم تشخيص المرض أو التأخير في اكتشافه وأحياناً وجود أمراض أخرى مصاحبة.. كما أن هناك مضاعفات بعد العملية، وقد ذكرنا جزءاً من تلك المضاعفات قبل العملية وبعدها وسنلخص المضاعفات الشائعة: 1- انفجار أو انثقاب التهاب الزائدة الدودية والذي تؤدي إلى التهابات في داخل البطن. 2- التهاب الصفاق الذي يغطي الامعاء ويحميها نتيجة إلى انثقاب الزائدة. 3- انسداد الامعاء وأحياناً شللها نتيجة أيضا إلى الانثقاب. 4- الخراجات داخل البطن. 5- خراجات في الكبد. 6- تسمم الدم بالجراثيم في حالات نادرة. 7- انسداد الامعاء بعد اجراء العملية وحدوث الالتصاقات المعوية. 8- العقم وخاصة في الفتيات والذي ينتج عن الالتصاقات أو انسداد القسم الأخير من انبوب فالوب الذي ينقل البويضة إلى الرحم وهذا يحدث في التهاب الزائدة البسيط ويتضاعف إلى حوالي 4 مرات بعد حدود الانثقاب.