اعتمد الاتحاد الآسيوي نظاماً جديداً لمسابقة دوري أبطال آسيا لكرة القدم لعام 2004 قضى بتوزيع الفرق على سبع مجموعات في الدور الاول من بينها أربع لغرب القارة وثلاث لشرقها، ضمت كل منها أربعة فرق تتنافس بنظام الدوري ويتأهل صاحب المركز الأول فيها للدور ربع النهائي إضافة إلى العين الإمارتي حامل اللقب، والذي أعفي من خوض منافسات هذا الدور. ووضعت قرعة الدور الاول، التي سحبت في كوالالمبور، باختاكور الأوزبكستاني مع الرفاع البحريني وزوب آهان الإيراني وقطر في المجموعة الأولى، والسد القطري مع الوحدة الإماراتي والقادسية الكويتي والقوة الجوية العراقي الثانية، والهلال السعودي مع الشارقة الإماراتي والأهلي البحريني والشرطة العراقي الثالثة، والعربي الكويتي مع الاتحاد السعودي وأصفهان الإيراني ونيفتشي الأوزبكستاني الرابعة، وتيرو ساسانا التايلاندي مع جوبيلو إيواتا الياباني وشنغهاي شنهوا الصيني وشونبكو هيونداي الكوري الجنوبي الخامسة، وداليان الصيني مع ماكاسار الأندونيسي وتاي بانك التايلاندي وهوانغ جيا لاي الفيتنامي السادسة، وسيوغنام إيلهوا الكوري الجنوبي مع برسيك الأندونيسي ويوكوهاما مارينوس الياباني وبيند دين الفيتنامي السابعة. ويقام الدور ربع النهائي بنظام خروج المغلوب من مباراتين وكذلك الأمر بالنسبة إلى الدور نصف النهائي. وتحدد موعد انطلاق المنافسات في 11 شباط فبراير وانتهائها في الأول من كانون الأول ديسمبر من العام ذاته. وأوقعت قرعة مسابقة كأس الاتحاد التي يشارك فيها 20 فريقاً، بعد اعتذار اتحادات الأردنوكوريا الشمالية وميانمار التي توزعت على خمس مجموعات، النجمة اللبناني ونيسا التركمانستاني وشعب إب اليمني وموكتيجودا من بنغلادش في المجموعة الأولى، والوحدة السوري والوحدة اليمني وماهيندرا الهندي وظفار العماني الثانية، وأولمبيك بيروت اللبناني والجيش السوري ونيبيتشي التركمانستاني ومحمدان البنغلادشي الثالثة، وبيراك الماليزي وفالنسيا من جزر المالديف وهابي فالي من هونغ كونغ الرابعة، ونيغري الماليزي وإيسن بانغال الهندي وجيلان السنغافوري وإيلاند من جزر المالديف الخامسة. إيقاف كوريا الشمالية اعلن الاتحاد الآسيوي عقب اجتماع للجنته التنفيذية انه اوقف كوريا الشمالية عن المشاركة في مسابقاته لمدة عام بسبب "قلة الجدية" التي اظهرتها تجاه هذه المسابقات. ولم تقم المباراة بين كوريا الشمالية والاردن ضمن تصفيات كأس آسيا لعدم منح الاولى تأشيرات الدخول للاعبين الاردنيين في الموعد، كما انسحب الكوريون من المباراة ضد ايران بعد سقوط مفرقعة على ارض الملعب فاعتبرت كوريا خاسرة صفر-3 في اللقاءين وغرمت بمبلغ 8 آلاف دولار عن الاول، وايران بمبلغ 10 آلاف دولار عن الحادث الذي وصفه الامين العام للاتحاد بيتر فيلابان بأنه "خطير جداً جداً". وكان الاتحاد الآسيوي فرض على ايران خوض 3 مباريات على أرضها من دون جمهور، لكن العقوبة خفضت الى مباراة واحدة بعدما ربحت ايران حكم الاستئناف للقرار السابق.