يقلل الختان لدى الرجال الى حد كبير من مخاطر الاصابة بالقوباء وغيرها من الفيروسات المتناقلة تناسليا، حسبما افادت دراستان نشرتا واكدتا فعالية ذلك في الحماية من فيروس الايدز. واظهرت الدراستان السريريتان اللتان اجريتا في اوغندا على 3393 رجلا تتراوح اعمارهم بين 15 و49 عاما تراجعا بنسبة 35% في حالات الفيروسات الحليمية المسؤولة خصوصا عن 70% من حالات سرطان الرحم. وفي المقابل، لا يؤثر الختان اطلاقا على مخاطر التقاط السفلس. واشار الدكتور توماس كوين من المعهد الاميركي للحساسيات والامراض المعدية واحد معدي الدراستين "هذا دليل على الفوائد الصحية للختان اذا تم تحت اشراف طبي". واضاف "هذا دليل على الفوائد الصحية المهمة لختان الذكور، بما فيها التقليل من مخاطر الاصابة بفيروس الايدز والقوباء التناسلية والفيروسات الحليمية والتقرحات التناسلية". واظهرت تجارب سريرية اجرها المعهد الاميركي للحساسيات والامراض المعدية في افريقيا ان ختان الذكور يقلل بنسبة 50% من مخاطر الاصابة بفيروس الايدز. وفي الولاياتالمتحدة يشهد الختان تراجعا بين السود والسكان من اصل اسباني وهما المجموعتان اللتان تشهدان العدد الاكبر من حالات الايدز والقوباء التناسيلية وسرطان عنق الرحم، بحسب معدي الدراسة.