قد تشهد منطقة الأمازون اضطرابات بيئية واقتصادية خطيرة إذا ما استمرت إزالة الغابات فيها بالطريقة القائمة حاليا، وقد تؤدي إلى انخفاض التساقطات المطرية انخفاضا شديدا، حيث من المفترض أن تنخفض التساقطات بنسبة 12% خلال الموسم الرطب، و21% خلال الموسم الجاف بحلول عام 2050 في الحوض الأمازوني وفقا لحسابات الباحثين. إلا أن تلك التقديرات هي الأولى من نوعها التي تستند إلى نماذج تستشرف تجفف الحوض الأمازوني وبيانات ميدانية تظهر أن نسب الأمطار تزداد في المناطق مقطوعة الأشجار. ويكمن السر في تلك المنطقة في ظاهرة البخر والنتح التي تسمح بالحفاظ على الرطوبة المحلية وبتوفير الكثير من المياه لطبقات عميقة تحت الأرض، فالأشجار المدارية تستخرج المياه من باطن الأرض وتضخها في الغلاف الجوي، قبل أن تتساقط المياه على شكل أمطار في الموقع ذاته أو في مناطق أخرى. وتتراوح نسبة هذه التساقطات في المناطق المدارية الرطبة، التي تضم أكثر من 35% من الغابات في العالم في مساحة تمتد على 11,5 مليون كيلو متر مربع، ما بين 25 إلى 56%. إلا أن النماذج المناخية تفيد بأن إزالة الغابات المدارية من شأنها أن تضعف هذه الآلية الحيوية، حتى إن أحد نماذج المحاكاة أظهر أنه في حال إزالة 40% من الغابات الأمازونية، سيتحول مناخ المناطق من مناخ مداري رطب إلى مناخ أشد جفافا. وتعد غابات الأمازون رئة العالم حيث إنها تشكل خزانا عملاقا لمادة ثاني أكسد الكربون المسبب للاحتباس الحراري. ويعتبر الحفاظ عليها محوريا في مكافحة التغير المناخي. ويؤدي تراجع معدلات نمو غابات الأمازون إلى انخفاض القدرة على امتصاص الانبعاثات الكربونية من الهواء؛ حيث تعد الغابات عنصرا هاما في دورة الكربون، وإذا عانت من الجفاف فسوف يؤدي هذا إلى ظهور خصائص جديدة لظاهرة التغير المناخي كنتيجة طبيعية لفقدان الكربون وتبعاته، حيث إن تدمير غابات الأمازون والحرائق الكبرى التي يضرمها المزارعون لتمهيد الأرض للزراعة السبب الرئيسي لإزالة الغابات، قد يساعد في تحفيز التغير المناخي. وبالإضافة إلى الكوارث البيئية المحتملة فإن إزالة غابات الأمازون تساعد على زيادة البعوض؛ الأمر الذي قد يؤدي إلى ارتفاع معدلات الإصابة بمرض الملاريا فقد أشار الباحثون إلى أن زيادة حالات الإصابة بالملاريا في مقاطعة بالبرازيل وصلت إلى 48% بعد إزالة 4.2% من أشجارها، حيث توصلت النتائج التي خلص إليها الباحثون في دورية الأمراض المعدية الناشئة إلى وجود علاقة بين قطع الأشجار وزيادة عدد البعوض والعدوى بين البشر. وكانت منظمة الصحة العالمية قد ذكرت أن الملاريا التي تنتج عن طفيل ينقله البعوض تقتل حوالي 860 ألف شخص سنويا على مستوى العالم، وهو الأمر الذي يخشاه العلماء.